外科分为外科一病区、外科二病区和外科三病区

外科一病区

主要开展普外科（肝、胆、胃肠）、泌尿外科、乳腺外科、烧伤、甲状腺等疾病的治疗。科室拥有副主任医师1名、主治医师2名、医师4名，配备了先进的德国进口电视腹腔镜系统，并配备有钬激光碎石设备，与厦门市中医院合作成立的 “厦门—彭州 联合腔镜治疗中心”在微创外科领域处于本地区领先水平。

微创外科手术具有创伤小、恢复快、疼痛小、疤痕小等优点，能开展腹腔镜下胆囊切除术、胃穿孔修补术、阑尾切除术、疝高位结扎术、无张力疝修补术、肾囊肿切除、肾上腺肿瘤切除、腹腔镜和胆道镜两镜联合行胆囊切除和胆总管切开探查取石T管引流手术、泌尿系统钬激光碎石手术等等。泌尿、普通外科在很好开展经尿道前列腺汽化电切手术的同时，很好的开展肾、输尿管、膀胱的结石及肿瘤等手术。很好的开展甲状腺、乳腺、肝胆、胃肠等各种疾病及肿瘤手术。烧伤外科开展各种烧伤植皮手术，对于各种烧伤病人的治疗处于我市先进水平。

外科二病区

科室主要开展胸外科、肛肠痔瘘科、神经外科、创伤急救外科、血管外科等疾病的治疗。科室拥有副主任医师1名，主治医师3名，医师2名，配备了肛肠治疗仪、脑治疗仪、医用低温治疗仪、肛肠疾病熏洗治疗仪。

胸外科收治各种胸部外伤、肋骨骨折、血气胸、肺挫裂伤、周围型肺癌、心包填塞、心包积液、食道癌、膈疝、膈肌损伤。神经外科收治各种头皮肿瘤、颅骨肿瘤、头皮挫伤、脑震荡、脑挫裂伤、硬膜外硬膜下血肿、脑内血肿、脑膜瘤、脑胶质瘤、脑室积液、慢性硬膜下积液、颅骨骨折、高血压脑出血。肛肠科收治各种内外痔、肛周脓肿、肛瘘、肛裂、肛窦炎、肛乳头肥大、肛管狭窄、直肠肛管外伤疾病。在中西医结合治疗肛肠痔瘘疾病、胸外伤及颅脑手术后的康复治疗、微创技术治疗高血压脑出血等方面具有丰富的经验。

外科二病区主要开展胸外科、神经外科、肛肠痔瘘科、创伤急救外科、血管外科等疾病的治疗，能开展各种胸外科手术、神经外科手术。肛肠科在中西医结合治疗肛肠痔瘘疾病方面具有丰富的经验。

外科三病区

外科三病区主要由神经外科专业组成，是集医疗、科研、教学、康复于一体的中西医结合全面型科室。科室注重学科规范、中西和谐、开放合作、特色发展，对神经外科常见病、多发病的诊疗，中医特色突出，西医技术规范而领先。

目前科室共有医师9人，其中主任医师1名、副主任医师1名、主治医师1名、高年资住院医师2名，住院医师4名。拥有国际上先进的螺旋CT、、DSA、1.5T磁共振双极电凝器、电动颅钻、铣刀、专用手术床及头架等尖端设备。以微创治疗高血压脑出血、脑脓肿，综合治疗重型颅脑损伤，手术治疗颅内肿瘤、脑积水，中西医结合治疗脑中风、脑外伤后遗症和功能性神经疾病等为特色。特别是建立了脑血管病、颅脑损伤急救绿色通道，保证病人在最短的时间内得到系统的专科治疗，大大提高了抢救成功率和好转率，制订了国内领先的围手术期中西医诊疗干预方案，充分发挥中医药特色优势，有效降低和消除后遗症及并发症，延长生存时间，提高生活质量 缩短康复进程。