2000年6月,胃肠肛肠外科隶属于大外科,2001年,成立普外科,2003年,普外科专科细化,肛肠外科独立建科,2013年,设独立病区,同年评为我院重点学科,2017年,更名为胃肠肛肠外科,2019年,医院开展专科专治,专收治胃肠、肛肠及疝疾病。学科分胃肠、肛肠、疝外科三个医疗组,床位54张。现有医护人员28人,其中主任医师3人,副主任医师3人,医师6人;护士18人,主管护师7人。2001年,学科成为我院重点学科;2005年,成为台州市重点扶持学科;2016年,成为台州市医学重点支持学科;2019年,成为医院重中之重学科。
2000年6月开诊以来,学科主要收治胃肠、肛肠、肝胆、腹壁疝及腹部创伤性疾病患者,门诊人次18余万,收治病人3万余人次,其中手术2万余人次。 2019年,医院开展专科专治,主要收治胃肠、肛肠及疝疾病,全面开展腹腔镜微创外科手术,并逐渐形成以胃肠道良恶性肿瘤规范、精准化综合治疗,胃肠道微创手术,常见肛肠疾病及腹壁疝个体化治疗为特色的学科