1975年3月周恩来总理做出了“一定要解决好锡矿工人肺癌防治”的重要指示，该院在中国医学科学院肿瘤医院专家的帮助下在云南省最早成立肿瘤科。1977年1月该院肿瘤放疗专业正式接诊放疗患者，是云南省最早开展肿瘤放射治疗的单位之一，并举办云南省第一届肿瘤放射治疗学习班。2003年成立了红河州肿瘤防治研究中心。

2011年1月肿瘤科发展为肿瘤外科、肿瘤放疗科、肿瘤内科，肿瘤放疗科成为云南省地州最早独立的放疗专科，同年经云南省卫生厅批准成为红河州肿瘤放射治疗中心。2013年该院肿瘤专业被评为第一批云南省肿瘤临床重点专科，肿瘤放疗科是重点专科的主要组成科室。放疗科 2019年评为医院第一批院内重点学科。肿瘤放疗中心于2020年5月18日增设二病区，中心两个病区实际开放床位达101张，已发展为云南省地州规模最大的放疗专科。

肿瘤放疗设备先后经历：钴60放疗机（1977年）、国产双光子直线加速器（2006年）、进口双光子直线加速器（2015年）。2010年在红河州内率先开展了三维适形放射治疗，2013年在州内率先引进内生场热疗机，配合放化疗，提高疗效，降低副作用。2015年在红河州内率先开展三维适形调强放射治疗，使该州恶性肿瘤的放射治疗技术及疗效达到国内外水平。目前该科开展各种肿瘤同步放化疗、术前放疗、术后放疗、免疫治疗、分子靶向治疗等。该院蒙自分院滇南肿瘤诊疗中心的建设，规划配置4-6台高端加速器、TOMO放疗系统、后装治疗系统、模拟定位CT等放疗相关设备，使该中心能开展后装、立体定向放疗等先进技术，提高放疗中心的诊疗水平。

红河州肿瘤放射治疗中心截止2020年6月有医务人员39人，医生14人，副主任医师3名，其中肿瘤学硕士研究生2名，主治医师3名，住院医师8名，5人在职研究生进修班结业；高、中级放疗物理师各1名，初级物理师4名，其中研究生2名，本科1名；技师8名，其中本科3名；护理17名，副主任护师1人，本科12名。先后获得红河州科技进步奖二等奖1项，三等奖3项，个旧市进步奖5项，在国家、省部级期刊发表论文50余篇。

2015年上海复旦大学附属肿瘤医院放疗中心钱浩教授工作站成立，2019年中心再与苏州大学附属第二医院的肿瘤放疗中心的张力元教授建立专家工作室，两位专家定期到该科对疑难病例诊治、放疗技术、科研学术及人才培养进行指导。中心医务人员先后到北京中国医学科学院肿瘤医院、上海复旦大学附属肿瘤医院、中山大学附属肿瘤医院、四川省肿瘤医院、云南省肿瘤医院等全国顶级的肿瘤专科医院进修学习，将最新诊疗规范、理念及先进的诊疗技术应用到肿瘤患者的诊疗过程中。

2018年该院正式转型为红河州肿瘤医院，2019年12月正式评为云南省第二家三级甲等肿瘤专科医院。该院蒙自分院云南省滇南肿瘤诊疗中心的正在建设中，待建成并投入使用，该院将是云南省地州规模最大、诊治经验最丰富、诊治手段最多、设备最齐全的肿瘤诊治中心。医院将进一步加大对肿瘤相关专业的建设，红河州肿瘤放射治疗中心也将以全新的精神面貌和姿态面对发展机遇和挑战，承担起红河州肿瘤放射治疗事业的发展与壮大的重任，不断学习、进步，为医院的发展、红河州的肿瘤防治工作贡献自己的一份力量。

患者康复是红河州肿瘤放疗中心每一位医务人员的共同努力的目标。2018年红河州肿瘤放疗中心因“2011年起坚持免费为放疗患者煮粥8年”被评为“感动三院集体”。