口腔科创建于1954年，当时合并于大五官科。60年代初，口腔科独立设科，并初具规模，业务上日常门诊拔、补、镶牙外，也开展中小手术。70年代开始手术范围扩大，能施行上下颌骨切除术、颌面部外伤术及涎腺手术等。80年代除中小手术外，还开展上下颌骨肿瘤切除术、颞颌关节成形术等1984年口腔科教学从外科教研室分出，正式成立口腔科学教研室担负起医学院医疗系、儿科系授课以及临床实习教学工作、还担负浙医大口腔系连续四届毕业实习教学的任务。90年代是该科各项专业发展较快的年代。进口10台西门子综合治疗台。　2003年担负口腔医学本科口腔颌面外科教学任务。2002年成立了口腔颌面外科中心，病房搬入新的急诊大楼，床位增至19张，颌面外科中心实力大大增强，开展的手术量也大幅度增加。2004年口腔临床医学(口腔颌面外科)被评为温医重点学科。2002年被评为院重点扶植学科。

2005年成为国家药监局的临床药物和医疗器械试验基地，开展了多项国内外临床药物和医疗器械的临床试验。2006年在原口腔科的基础上结合其它相关医技科室组建成立口腔医疗中心，2007年成为国家口腔专科医生临床培训基地。同时中心还是全国微笑列车基金会唇腭裂救治慈善项目的合作单位，自2001年来，开展了200多例唇腭裂手术，为国家的慈善事业做出了贡献。

2012年医院搬入新院后，口腔医疗中心得到了进一步的发展。目前口腔医疗中心拥有颌面外科、口腔内科、口腔修复科、口腔正畸四大专科和中美合作口腔种植中心，分为牙科和颌面外科两大部分。并设口腔科学教研室1个、口腔颌面外科教研室1个、中美合作口腔材料研究所1个。

口腔颌面外科病房位于新院住院部1号楼7层（171病区），共设37张床位，在颌面部肿瘤的手术治疗和放化疗、唇腭裂的整复及序列治疗、颌面外伤的诊治及颞颌关节病治疗等方面具有特色，年收治颌面外科病人1500余例。颌面外科目前已开展的项目大部分都达到浙南地区领先、省内先进水平，某些技术如髁突骨折及颞颌关节病的手术治疗、颌面部恶性肿瘤手术切除后的游离皮瓣修复及鼾症治疗等甚至在省内领先。1988年率先在浙南地区开展口腔癌联合根治+游离前臂皮瓣、胸大肌肌皮瓣、腓骨肌瓣等修复术、颅底肿瘤切除术、运用游离背阔肌肌皮瓣修复面中部大面积缺损、上颌骨扩大切除眶下板及上颌骨重建术等复杂手术。2003年开展省内首例颞下窝肿瘤累及颅中窝的手术获得成功。

牙科门诊老、新院区均有开设，拥有2100平米的医疗及教学用房，设口腔综合治疗台40张，全部采用德国和美国的先进设备，开展牙体牙髓牙周、口腔黏膜、儿童牙病、颌面外科、人工种植牙、口腔修复和口腔正畸等临床诊治项目。2003年，在温州及浙南地区率先开展了ITI种植牙的临床应用，并取得良好的效果，5年成功率达98%以上。现已开展各种复杂病例的种植牙修复，包括自体块状骨植骨、上颌窦内外提升、即刻种植、前牙美学种植修复及全口种植固定义齿修复等技术。近年来相继开展激光在牙周病治疗中的应用、种植支抗在正畸治疗中的应用、口内矫治器治疗鼾症、精密附着体修复牙列缺损及全口义齿等修复治疗项目。门诊高度信息化，采用电子病历及数字化摄片，并可以预约就诊，减少了病人的等候时间。

中心拥有一批经验丰富的医护人员，现有医师27名，护士9位，其中有正高职称6人，副高6人，中级职称8人，硕士生导师3名，具有博士学位2位、硕士学位17位。拥有中华口腔医学会颞下颌关节病学及牙合 学专委会委员1名、全国颌面外科呼吸睡眠障碍学组理事1名、中国睡眠研究会理事及中国睡眠研究会睡眠呼吸障碍专业委员会委员1名，浙江省口腔医学会口腔颌面外科专委会副主委1名及委员2名、浙江省口腔医学会口腔内科专委会、正畸专委会、修复专委会及种植专委会委员各1名、温州市口腔医学会副会长1名、入选省“151人才工程”第二层次和第三培养人选各1名、市“551人才工程”第一层次和第二层次培养人员个1名。

科研力量雄厚，为临床提供了有力的基础支持。2001年以来共申请到1项国家自然科学基金、2项浙江省自然科学基金和1项省科技厅项目，近20项浙江省教委课题基金、浙江省医药卫生课题基金和市科技局项目，其中省自然基金是医院首次获得的较高级别的科研课题资助，开创了科研工作的新局面。2004年与北京协和医院合作，开展国家“十五”科技攻关“阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征（OSAHS）多中心多学科流行病学调查、综合治疗体系建立及疗效评估研究”；2005年与美国罗马琳达大学合作开展《Periowave激光系统治疗成人慢性牙周病的临床研究》，取得了显著的成效。目前获国家发明专利授权2项和实用新型授权3项，出版著作及教材5部，其中《口腔医学美学》获卫生部优秀教材三等奖、《鼾症-——健康的红色警报》获温州市科普创作特等奖。近5年来发表论文80多篇，其中SCI收录8篇，中华系列8篇。科研成果获奖也有了突破性发展，获得省科学技术三等奖1项、省高校优秀科研成果奖、省医药卫生及温州市科技进步奖7项，省自然科学优秀论文二等奖2篇，多篇论文获温州市自然科学优秀论文奖。与国内外知名牙科院校建立了长期的合作关系。2005年与美国罗马琳达大学牙学院合作成立了温州医学院中美合作口腔材料研究所，2008年成立了中美合作口腔种植中心，双方经常互派人员进行学术和临床医学交流。目前中心已有6人到美国罗马琳达大学牙学院参观访问学习，2006年以来参加IADR（国际牙科研究协会）年会学术交流8人次。2006年与上海交通大学合作承办睡眠呼吸学习班；2009年承办第二届全国睡眠呼吸障碍学术会议，在国内享有一定的声誉和影响力。中心有多名医师到上海交通大学附属第九人民医院进修学习。