自1988年吉大一院二部成立伊始就设置了儿科，科室本着“大综合、小特色”的原则，逐渐发展壮大，现今已牢牢立足于长春东部，辐射外周市县，成为长春东部不可小觑的儿科力量。科室是长春东部最大的综合儿科，东北三省小儿内分泌遗传代谢协作组组员单位，是总院小儿内分泌科的协作病房。
科室现共有医生14人，护士22人。14名医生中，硕士生导师1人，主任医师2人。其中博士4人，硕士9人。其中有2人有于美国进修学习经历。全部护士均具有大专以上学历，已获得本科学历9人，在读本科6人。
科主任徐乃军，硕士研究生导师，获得院优秀教师荣誉，担当第一、第二届大学生技能大赛指导教师工作，并获得好评。从医20多年，积累了丰富的临床工作经验，尤其擅长发育儿科、小儿内分泌代谢疾病、新生儿疾病及结缔组织疾病的诊断治疗工作。
科室承担七年制、五年制本科及留学生的全英语教学工作。近3年承担国家自然科学青年基金1项、吉林省科技厅科研课题1项、横向课题2项，获得科研资助50余万元。近3年发表学术论文10余篇。
二部儿科现年门诊量超过10万人次，为总院儿科门诊量的1/5，年收容病人达到3000人次左右。常年开设儿科急诊，24小时为儿童患者提供优质服务。科室拥有先进的NIHON KOHDEN视频脑电图仪、经颅多普勒超声仪、24小时心电监护、振动排痰机等仪器，并有专人开展小儿智力测试。极大提高了儿科常见病、多发病及疑难杂症的诊断及治疗水平。
科室逐步开展小儿脑瘫、孤独症、神经系统疾病、遗传代谢病等的诊断与治疗，即将开展运动疗法、作业治疗、言语训练、感觉统合训练、经络导平、肌兴奋治疗仪、痉挛治疗仪、高压氧治疗等。
科室是一个学术气氛浓厚，积极奋进、团结向上的集体。医护人员在工作中，禀承“一切为了孩子，为了一切孩子”的服务宗旨，全心全意为患儿服务，同时医疗、教学、科研、人才培养等方面全面发展。
