遗传咨询科，即医学遗传与产前筛查（诊断）科，成立于2017年11月，绍兴市产前诊断中心依托医学遗传与产前筛查（诊断）科负责全市产前筛查和产前诊断工作的组织实施，对各基层产前筛查工作开展督查、质控和培训，对每位进行产前筛查及产前诊断的孕妇实行专科档案管理和健康教育，及随访和登记工作，并定期进行数据和资料的汇总、分析、上报。
目前科室开设遗传咨询门诊、遗传病门诊、无创门诊及胎儿医学门诊，提供孕前、孕期优生与遗传咨询服务、先天性缺陷及遗传性疾病的产前筛查、诊断并提供部分宫内治疗手段及转诊。开展早中孕唐氏筛查、无创DNA检测、有创检查，包括绒毛、羊水及脐血染色体检查及染色体微阵列等临床项目，设有创穿刺后留观病房以利于孕妇更好的休息及观察。
