骨科创建于1997年8月，是治疗骨关节疾病专科。通过不断提高医务人员综合素质和专业技术水平，科室得到了极大发展，技术水平位于全州前列。科室设有脊柱外科、关节外科、创伤外科、显微外科等专业组，开展断指（肢)再植术、神经移植、血管移植、带蒂皮瓣转移、脊柱侧弯矫形术、颈腰椎前后路手术、胸椎后路手术、人工全髋关节置换术、人工全膝关节置换术、人工肩关节置换术、各种复杂的四肢骨折复位固定术。微创技术方面开展关节镜手术、椎体成形术、椎间孔镜手术、经皮椎弓根螺钉固定等手术。对各种骨关节疾病的诊疗经验丰富。科室是医院的文明科室和重点专科，2015年10月通过评审成为云南省重点专科建设科室。科室获得文山州科技进步奖一等奖一项、二等奖二项、三等奖二项；获得文山市科技进步奖一等奖一项。