医院1962年筹建并开展临床病理工作，目前病理科是川东北唯一集临床、教学和科研为一体的病理诊断科室，拥有本地区实力最雄厚的病理医技人才和众多先进仪器设备。现有医技人员41人，其中医生26人，教授3人、副教授3人、主治医生14人、住院医生6人。并拥有一支训练有素的实验技术队伍，其中副主任技师2人，技师2人，技士2人，见习员9人，辅助人员2人。科室现有博士3人、硕士24人，学习归国回来5人。川北医学院名师1人，学术与技术带头人1人，中青年骨干教师4人。
科室有四川省卫计委学术技术带头人1人，候补人员1人。现有任中国医师协会病理学分会委员1人，中国老年医学学会病理分会第一届委员会委员1人，四川省医学会病理学专委会副主任委员1人、常委1人、委员2人，青年委员1人；四川省肿瘤病理学副主任委员1人，委员1人；四川省预防医学会妇科肿瘤控制分会副主任委员1人；四川省病理质控专家2人。南充市医学会病理学专委会主任委员1人和副主任委员2人。南充市病理质控中心主任1人，副主任2人，质控专家5人。是南充市病理质控中心和南充市远程会诊中心挂靠单位。
2010年获四川省病理学教学团队。2011年《病理学与病理生理学》成为独立的二级学科点.本学科自2007年开始，独立招收研究生。2012年获四川省医学重点学科，2015年通过了四川省医学重点学科（甲级）的验收。2013年成为临床病理学二级学科点，2015年又开始招收临床病理学专业学位研究生。2015年病理学成为四川省精品资源共享课建设学科，2017年四川省精品在线开放课程。
二、主要服务范围
1.常规活体组织检查
所有手术标本，包括身体各部位的穿刺组织标本、脏器标本、骨骼标本以及纤维胃镜、肠镜、支气管镜、喉镜的活体标本等，均可进行活体组织检查，以明确病理诊断、指导临床治疗，了解治疗效果或判断预后等。
2.术中冷冻切片快速诊断
将新鲜病变组织在恒冷切片机中迅速冻硬后制成HE染色切片，单件标本一般在30分钟内做出病理诊断。主要用于手术进行过程中的快速诊断参考，为临床手术治疗提供及时可靠的依据。如确定肿瘤的良恶性，了解恶性肿瘤的扩散情况，确定手术切缘有无肿瘤残留等。另外，检测某些需保持其生物活性的抗原物质和抗体，也须采用冰冻切片。
3.免疫组织化学染色主要应用于
①辅助疾病尤其肿瘤的诊断和鉴别诊断。
②确定肿瘤分期、及时准确的发现微小转移灶。
③辅助淋巴造血系统肿瘤的组织学分类及分型。
④检测与肿瘤预后密切相关的生物学指标。
⑤为临床提供治疗方案的选择。如乳腺癌ER、PR、Her-2的检测，胃肠道间质瘤CD117的检测、CD20阳性的弥漫性大B细胞淋巴瘤、肺癌ALK检测等。
4.特殊染色
为了确定组织细胞中的正常结构或病理过程中出现的异常物质、病变及病原体等，需要分别选用相应的显示这些成分的染色方法进行染色。包括：胶原纤维染色、网状纤维染色、肌肉组织染色、脂肪染色、糖原染色、粘液染色、抗酸染色、淀粉染色等，以辅助病理诊断。
5. 细胞学检查
细胞学的标本可以是来自呼吸道、消化道、泌尿生殖道等分泌、排泄物中的脱落细胞，也可以是经穿刺抽取的（胸、腹、心包腔、关节腔、脑脊髓膜腔）各种体液中的脱落细胞，还可以是经各种内窥镜刷涂片采集的细胞，经细针吸取技术直接或X线引导下穿刺吸取出的全身各组织器官病变处的细胞等，将这些细胞直接或经离心沉降等方法处理后涂片、固定、染色，在显微镜下观察、诊断。主要应用于恶性肿瘤的诊断和筛查。
6.分子病理诊断
已经开展的分子病理技术有细胞/组织原位杂交、和荧光原位杂交（FISH）技术、循环肿瘤细胞检测（CTC）等，可以检测肿瘤相关病毒（如EB病毒、HPV病毒），协助肿瘤的诊断以及感染性疾病的诊断；指导肿瘤个体化和预见性治疗（如了解乳腺癌病人HER-2基因扩增情况的），检测血液循环中的代表肿瘤负荷的肿瘤细胞数辅助复诊诊断、疗效评估、术后复发转移预测与监测等。
7.快速石蜡
部分小组织（直径在0.5cm～1.5cm）如胃镜活检、宫颈活检等，可以在收到标本1个工作日（24小时以内）发出病理报告。
8.疑难病理会诊和尸体剖检
9.其他
科室还常年承担进修生和专科医师培训工作，协助各科室老师完成科研课题和研究生课题。
三、学术科研成果
近五年来承担并参与了国家级、省级和厅局级科研课题研究30余项、发表学术论著100余篇，主编和参编教材和教辅书籍10余部，曾荣获卫生部科学大会奖、四川省政府科技成果奖和南充市科技进步奖。病理切片、病理诊断多次获四川省各种奖项。现已形成“消化道肿瘤病理”、“妇科肿瘤病理”、“乳腺病理”、“软组织病理”、“淋巴造血系统病理”等多个亚专业方向。
四、医疗设备
病理科仪器设备先进，拥有进口生物组织切片机、恒温冷冻切片机、全自动组织脱水机全自动染色机（HE和免疫组化）、荧光显微镜、生物显微镜、彩色图文摄影分析系统、原位杂交仪、PCR仪、凝胶成像系统、CO2培养箱、十人共用多头显微镜、包埋盒打印等。能够完成组织和细胞的常规制片技术、免疫组织化学技术、荧光原位杂交（FISH）技术、特殊染色技术等，为教学、科研、临床搭建了较高的服务平台。
五、科室特色医疗技术
1.免疫组织化学技术
2.FISH技术
3.循环肿瘤细胞检测（CTC）
4.细胞/组织原位杂交技术
5.术中冷冻切片快速诊断
6.快速石蜡
