南京大学医学院附属金陵医院神经内科是中国神经病学界建立最早的专科之一，其前身为1929年筹建的国民政府中央医院神经科。现为南京大学神经病学研究所、国家药物临床试验基地，是南京大学医学院、南方医科大学博士和硕士研究生培养学科，是南京总医院博士后招生学科。 学科在2007年和2011年被评为江苏省重点学科（实验室）。

南京大学医学院附属金陵医院神经内科每年成功救治来自全国各地的大量复杂疑难病例，形成了以脑血管病、神经血管介入、癫痫、痴呆、脑神经损伤康复、帕金森病和神经变性病等为主要特色的医疗技术优势。

南京大学医学院附属金陵医院神经内科在国内神经内科系统率先引进并开展了脑血管病介入诊疗技术，拥有一流水平的脑血管介入专家队伍，并建立了国内神经内科系统首个脑血管介入中心，配置了首台DSA机。在颅内外动脉狭窄血管成型和支架置入术、动脉溶栓治疗、脑血管闭塞后再通等新技术方面均取得显著疗效。迄今为止治疗例数、技术难度和疗效均居国内领先水平。2005年被国家卫生部确定为“全国颈动脉和脑血管病介入诊疗培训基地”，已为全国各地医院培养了数百名脑血管介入人员，为脑血管病介入治疗新技术的迅速推广做出了重要贡献。同时科室开通了医院卒中绿色通道，将“时间就是大脑”的理念融贯于急性脑血管病救治的全过程，每年有千余名急性卒中患者在最短时间内进入卒中单元得到最佳治疗，有效降低了中风患者的致残率和致死率，取得良好的社会和经济效益。

南京大学医学院附属金陵医院神经内科附设的神经电生理中心拥有一系列先进精密的诊疗设备，长年开展脑电图、睡眠脑电图、脑地形图、视频脑电、动态脑电图、肌电图、神经传导速度、诱发电位、感觉定量和生物反馈等多项检测，为神经肌肉疾病、神经变性疾病、脑神经损伤的诊断提供了重要的科学依据和良好的治疗指导。

南京大学医学院附属金陵医院神经内科目前承担国家、省市级各类基金课题20余项，获科技成果奖15项。近三年来在国际上发表SCI论文30余篇，在国内专业核心期刊发表论文200余篇，主编国际英文杂志，主编专著多本。受世界卒中组织的委托，每年主办一次国际脑血管病高峰论坛。

南京大学医学院附属金陵医院神经内科率先创建了国内首个网络化、区域性的南京卒中注册系统，截至2009年初，已经入组5000余例脑血管病患者，成为东亚地区规模最大的脑血管病数据库，已成为国际神经病学界了解中国脑血管病现状的重要窗口。以南京卒中注册系统为平台，对脑血管病患者进行全面、系统、长期的跟踪研究，为各种治疗和干预因素的安全性和有效性提供观察平台。同时科室将注册系统与脑血管病临床规范化和住院医师临床培训相结合, 使进修医生和研究生通过此平台的资料转换和录入来掌握脑血管病的临床规范化诊疗。

现为南京大学医学院南方医科大学神经病学博士和硕士研究生培养学科及南京总医院博士后招生学科。学科立足于医学发展前沿，融医疗、教学与科研为一体，更新教学观念，深化教学改革，逐渐形成“具有一流师资队伍、一流教学条件、一流教学质量的医学创新人才培养点”。年招收博士后、博士和硕士研究生10余名，并与国内外知名大学和研究所长期合作交流研究，定期选派优秀人员赴国外进行联合培养。多年来建立了完整的研究生培养机制，将临床技能培训（神经血管介入技术）和研究生培养有机的结合起来，使大批研究生不但掌握了脑血管病血管介入技术，而且在脑血管病病因学、遗传学、病理学等方面做出了突出的研究成果。学科每年还接受50余名来自全国各地三级以上医院的医护工作者进修，并于07-08年接受4名国外神经科医生来科学习。