急诊医学科成立于1987年，先后有王怡峰教授、周水生教授、闻正举教授、钱晓明教授、孙海晨教授担任科主任，现任科主任聂时南教授。经过三十余年发展，在医院党委、机关的坚强领导和无微不至的关怀下，在全院兄弟科室的大力支持下，在历届科室领导和全科同志共同努力下，尤其“十二五”以来的快速发展，科室已形成以急危重病救治、心肺脑复苏、急性中毒救治、急性重症感染、胸痛、卒中、创伤三大中心及危险性上消化道出血快速通道、批量伤员救治、突发公共卫生事件应急处置为特色的急诊医学中心和集医疗、教学、科研和卫勤保障于一体的综合性二级学科，是国家及江苏省急诊医师规范化培训基地、中国急诊专科医联体单位、中国心肺复苏联盟单位，中国中毒急救联盟单位，全军临床急救技能培训基地、原南京军区急诊医学中心和南京市重点专科。

2017 年度获中国医院急诊专科声誉排行榜全国提名，2018 年度中国医院科技量值急诊医学排行榜全国排名第五名。现为南京大学、南京医科大学、南方医科大学、东南大学及南京中医药大学博士研究生招生学科、全国博士后工作站急诊专业招生学科。

科室成员兼任国家卫健委应急处置指导专家，中国急诊医联体副主席，中国医师协会急诊医师分会副会长，中华医学会急诊医学分会全国委员，全军急救医学专业委员会副主任委员等多个国家、军队、省市级副主委、常委、委员等学术职务。兼任《中华急诊杂志》、《中国急救医学》、《临床急诊杂志》、《解放军医学杂志》等杂志常务编委、编委及青年编委。多人分别留学美国、德国、新加坡和香港，多名骨干分别入选“江苏省有突出贡献的中青年专家”“江苏省第五期333高层次人才”培养工程第三层次培养对象、“江苏省青年医学人才”及“全军青年培育项目人才”。

科室担负着体系部队、演训部队、南京及周边地区急诊患者的救治任务，年急诊量近20余万人次，年抢救危重病人近2 万人次。曾成功抢救心搏骤停78分钟患者、成功救治极急危重多发伤患者和重度百草枯中毒患者。

科室荣立集体二等功1次、三等功3次，1人荣立二等功、10人次荣立三等功。多人分别获全国首届“白求恩式好医生”、 “武汉联勤保障基地优秀党员”、“首届感动无锡联保中心十大人物”、“江苏省有突出贡献中青年专家”称号。科室荣获2019年第七届全国医院品管圈大赛急诊专场一等奖桂冠。

在历次重大突发公共卫生事件及部队批量伤员抢救中发挥了重要作用，多人参加了医院国家应急救援医疗队、医院机动卫勤分队、处置“日遗化学武器”医疗保障组、汶川地震伤员救治、安徽手足口病救治、“神九、神十、神十一”备勤、濒海训练、演习、亚青会和青奥会保障、“援非”、扶贫援藏及“武汉抗疫”等大项活动，科室五人小分队完成了大量的应急保障任务，受到部队官兵及省、市的表彰和奖励。

近年来共获得包括国家自然科学基金、全军面上课题等外源性课题34项，申请专利8项，主编、参编专著11部，在国内外学术期刊共发表文章200余篇，执笔及参编中国急诊专家共识10余部，获军队科技进步二、三等奖共5项，多次承办了全军急诊医学学术年会、金陵急诊高峰论坛等大型学术会议及活动。