药学部是医院建院时最早成立的专业科室之一，技术力量强，设施完善，部门齐全，承担着医院医疗、教学、科研所需的各项药学专业服务工作。目前总建筑面积6000m2，设有7个调剂室、静脉用药调配中心、中西药库房、临床药学室、临床药学实验室、药学信息情报资料中心、药品质量监控室、制剂室等部门。

药学部现拥有职工233人，其中药学专业技术人员196人，具有博士学位10人，硕士学位45人；高级技术职称30人，中级技术职称58人，建立了合理的人才梯队。药学部已配备全自动发药机和单剂量摆药机，实现了药品调剂的自动化，提高了工作效率和服务质量。

药动与药效实验室和免疫实验室配备仪器国内先进，包括WatersUPLC-XevoTQS质谱联用仪、Waters超高效液相色谱仪、安捷伦1200高效液相色谱仪、岛津2550紫外分光光度计、高速冷冻离心机、氮吹浓缩仪、百傲全自动杂交仪（二代）和生物芯片识读仪、ABI实时荧光定量PCR仪及普通96孔型PCR仪、德国蔡司倒置荧光显微镜及普通光学显微镜、美国Odyssey双通道红外激光扫描仪、美国UVP凝胶成像系统等。

目前，实验室已与美国哈佛大学麻省总医院癌症研究中心建立长期合作，研究肿瘤患者的个体化用药。