科室开放床位60张，现有医务人员40名，其中主任医师2名，副主任医师2名，硕士4名，承担福建医科大学临床医学本科生的教学任务，由消化内科病房、消化内科门诊和消化内镜室组成。该科室以“消化系疾病的内镜诊断和治疗”，“慢性肝病基础和临床研究”，“肝癌介入治疗和肝硬化脾动脉部分栓塞”，“消化道息肉化学防癌”以及“消化道大出血治疗”为专业特长。消化系疾病的病种齐全，成功救治了大量消化系急、危、重症患者，在上消化道大出血、急性重症胰腺炎、肝硬化肝性脑病、伪膜性肠炎等危重病症的抢救治疗上达到了先进水平。
设有消化内镜室和内镜培训中心，配备14条电子内镜、超声内镜、双管道胃镜、注水内镜（ESD用）等，进口MMS 36通道高分辨率全食管、肛门直肠压力测定和便秘生物反馈治疗是目前国内最先进胃肠动力检查系统之一，展开了胶囊内镜检查和13C呼吸试验。
无痛胃肠检查是内镜特色之一，除完成常规的电子胃镜、电子肠镜外，该科室可进行以下技术：1、消化道各种异物的取出；2、消化道息肉的切除；3、消化道大出血的内镜下止血；4、超声内镜检查；5、晚期消化道恶性肿瘤的内镜综合治疗；6、各种消化道良 恶性狭窄的内镜治疗；7、金属支架对食管、十二指肠、结肠梗阻狭窄的治疗；8、Barrett食管内镜下治疗；9、ERCP及支架置入术；10、对消化道早癌、粘膜隆起、粘膜下肿瘤（平滑肌瘤、间质瘤、脂肪瘤、类癌、异位胰腺等）进行内镜下粘膜切除术（EMR）、粘膜剥离术（ESD）及挖除术（ESE）。
布谷医生
