小儿内科创建于1960年,为闽东地区第一个对小儿疾病进行专科治疗的科室,现已发展由住院病房、儿科门诊、儿科急诊组成,专业较为齐全,集医疗、教学、科研、预防为一体的综合学科。是福建省儿科住院医师规范化培训基地,承担福建医科大学儿科临床理论课及见习、实习教学任务,是院级重点专科。编制床位66张,实际开放床位90张。现有医务人员41人,其中主任医师1名,副主任医师2名。
科室配有心电监护仪38台、婴儿抢救台2台、暖箱4台,有创呼吸机3台、无创呼吸机1台。开展呼吸道疾病,包括小儿哮喘,上、下呼吸道感染性疾病,消化系统各种疾病,特别是小儿腹泻、胃肠道功能紊乱;泌尿系统疾病,肾炎、肾病综合征;各种急性中毒;各种急危重症;各种中枢神经系统感染性疾病;各种血液系统疾病;各种心血管系统疾病;各种营养性疾病;各种免疫性疾病,如川崎病、过敏性紫癜等诊治。