东莞市第三人民医院药学部历史悠久，经历了100多年的风雨历程，传承并沉淀了几代人的勤劳和智慧。在医院各级领导和相关科室的支持下，经过全体员工的不懈努力，药学部已从原来传统的单纯药品供应发展为集药品供应、处方调配、药品不良反应监测、药学信息和药物经济学研究、临床药学工作、贯彻执行药政法规于一体的三级甲等综合性医院科室。是东莞市医院药事管理质量控制中心挂靠单位 、东莞市医院协会药事管理专业委员会主委单位 、东莞市临床药师培训基地，2017年，门诊西药房获“ 广东省青年文明号”。

目前该院药学部拥有药学专业技术工作人员77人，其中高级技术职称6名，中级职称19名，初级职称50名，本科学历占45%，硕士研究生6人，已形成学历、职称、年龄构成较为合理的工作团队。

药学部下设有药剂科、临床药学科及药物实验室，静脉配置中心已选址正在筹建中，科室倡导人文文化服务理念，“以人为本，以患者为中心，密切联系临床”是科室工作的指导思想。近五年来，药学部还积极开展药学科研与教学工作，获省、市级科研课题项目15项，在国内外刊物发表论文50余篇，其中中文核心期刊9篇， 第一单位第一作者被 SCI收录论文6篇，总影响因子达18.57（其中一篇 IF=7.51）。

药学部严格执行《药品管理法》，《处方管理办法》等法律、法规要求，做到“四查十对”，实行配药、发药双核对，提高了准确性。各药房在完成繁重的医疗任务的同时，注重提高服务质量、文明服务、礼仪待人，改善服务态度，创建患者满意窗口。各药房采用全院联网微机系统，能为患者提供药物查询、价格信息查询、处方查询等服务。为更好地与患者沟通，从2004年起，他们实行“开放式”发药形式，能更好对患者进行用药交待和用药指导，解决患者的药物咨询。2012年通过信息平台的建立，门诊患者所有用药信息均实现电脑打印发药标签，提高了发药效率并减少调剂差错，同时患者也能更清楚了解用药信息，提高了患者用药的依从性，2017年，中心药房引进单剂量口服药自动分包机、2018年引进口服药自动核对机，提高了调剂质量和工作效率。2004年门诊大药房被广东省食品行业协会、广东省医药行业协会评为“广东省食品药品放心工程示范点”；2007年获得东莞市团委授予市级“青年文明号”称号， 2017年，门诊西药房获“ 广东省青年文明号”称号。2010年，药学部开设“门诊用药咨询窗口”，2017年10月开设药学专科门诊，安排专职临床药师为患者提供“一对一”精准用药服务，解答患者在用药中遇到的疑惑和问题，宣传正确的用药方法和合理用药知识。2016年，该院作为首批被市卫计局认定的东莞市临床药师培训基地，目前共培训5期共20名学员，学员经考核合格均获东莞市临床药师岗位培训证书。药学部每年接收大中专药学实习生20多人，承担市内二级医院、医联体—松山湖社区卫生服务中心药学人员的进修培训带教工作。