传染科位于我院感染病治疗中心1-2楼，是医院一级科室，主要负责感染性疾病及法定传染病的防治，南京军区急性呼吸道传染病定点收治医院。感染性疾病是指由生物因子（如朊毒体、病毒、支原体、衣原体、立克次体、螺旋体、细菌、真菌、原虫、寄生虫等）引起的人类疾病或人兽共患性疾病。法定传染病是指我国“传染病防治法”认定的有较强传染性的感染性疾病。科室现有床位12张，医护人员10名，其中硕士2人，本科5人，专科3人。现为安徽医科大学硕士培养点，承担第二军医大学、江苏大学、安徽医科大学、徐州医学院等院校本科医学生的教学任务。
感染病治疗中心对各型病毒性肝炎、肝纤维化、肝硬化的科研有较深入的研究，对各型病毒性肝炎、肝纤维化、肝硬化、肝癌，尤其对重症肝炎及慢性肝炎的诊断、治疗有较丰富的经验。
感染病治疗中心对疑难性的诊断、治疗也有较多经验，如先天性黄疸、糖原积累综合症、后天性黄疸、慢性肝炎合并肾小管性酸中毒、门静脉胆总管痿、布一加氏综合症等。
感染病治疗中心对中心对其他发热性疾病（长期高热、低热），如败血症、亚败血症、L-型细菌败血症、出血热、弓形虫病、毛霉菌病、疟疾或不明原因发热等疾病都有相当成功的经验。
获奖情况：
科室多次获得医院先进科室称号，2007年获得医院护理操作技术比武第一名，发表论文41篇，在核心期刊发表文章23篇，获得军队科技进步奖二等奖1项，三等奖3项，1人获得南京军区优秀中青年科技人才、1人获得联勤部科技练兵优秀青年标兵称号，8名同志被评为优秀共产党员，3名同志荣立三等功。
重大任务完成情况：
2003年3人参加北京小汤山医院抗击非典；2005年1人赴利比里亚执行维和任务；多人参加南京军区军事演习。2009年成功抢救一例危重甲型H1NI禽流感患者。
疾病收治范围
1、急慢性病毒性肝炎：甲型肝炎病毒、乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、丁型肝炎病毒、戊型肝炎病毒等。
2、急性肝衰竭的抢救治疗：肝炎后肝硬化、肝癌的诊断与治疗，人工肝治疗。
3、感染性疾病：各种感染性疾病（细菌、真菌及病毒性疾病）的诊断治疗、管理与控制，传染病筛查、预警、防控工作，对传染病早发现、早报告、早治疗，及时控制传染病的传 播，有效救治伤寒、副伤寒、流行性出血热、流行脑脊髓膜炎、乙型脑炎、化脓性及结核性脑膜炎、肠道传染病、破伤风、狂犬病、性病等法定传染病患者。
4、发热性疾病：主要发热疾病的诊断及鉴定诊断，感染及非感染性因素引起的急、慢性发热的诊断、鉴别诊断和治疗。
