集职能、业务、教学、科研于一体，以促进临床科学、合理用药为基础的药学技术服务部门。该院是重庆市最早开展中药饮片小包装服务的医疗机构，并获得“重庆市科学技术成果奖”。随着李渡总院投入使用，实现了智慧化药房，住院患者静脉药物集中调配；配备了现代化智能煎药机，能为门诊及住院病人提供快速、优质的煎药服务以及智能物流轨道保证药房与各个病区无缝连接。
药学部下设中药小包装饮片配方2处、中药免煎颗粒配方3处、门诊中成药、西药配方3处、住院中成药、西药配方3处、中药煎药室2处、中药库房、中成药及西药库房、集中式静脉药物调配中心、临床药学、药品采购以及制剂室等部门。配备有小包装饮片，中药配方颗粒，中成药和西药，以满足临床不同患者的需求。目前有中药饮片500余种，配方颗粒400余种，中成药300余种，西药700余种，能充分保障临床各种特色用药的需要，并能提供中药传统工艺制作，散剂、膏方等，为患者提供365天全年无节假日就诊服务。
现有职工43人，其中药学专业39人，占90.70%；副主任药师2人，主管药师5人；硕士2人、本科学历12人、大专学历23人。
布谷医生
