1960年骨科与普外科、泌尿外科共同组成一个外科病区。由泌尿外科宁天枢教授任主任，床位40张。除开展一般的手术治疗外，还积极开展关节融合术、腰段椎间盘髓核摘除术、脊柱结核清创术等，治疗效果满意。
1979年，对越自卫反击战的开始，大量骨伤伤员使骨科单独成立病区，床位40张，陈受谦教授任骨科主任，同时兼任野战外科研究所三室主任，李万卿任骨科副主任。奉上级指示，骨科病区全部收治对越自卫反击战的伤员。同时，选派谭肇铿、刘长江、付样林、彭学良4人先后分两批参加医疗队赴“对越自卫反击战”的前线支援，圆满的完成了上级分派的任务。
1980年下半年，待对越自卫反击战的伤员痊愈出院后，开始收治其他骨科病人。以陈受谦、林贵德、刘长江等为代表的研究小组人员，通过对脱钙骨、基质胶移植的研究，于1983年开始将科研成果应用于治疗骨缺损、骨不连或延迟愈合、肿瘤骨缺损、人工关节置换、脊柱融合术等。1989年，开始应用异种脱钙骨移植，临床应用成功率达91.31％。1986年陈受谦教授招收该科第一名硕士研究生----潘继承，1989年顺利毕业。
自1983年，骨科与外研所三室行政领导分开，骨科由李万卿教授任主任，谭肇铿教授为副主任。在李万卿、蒋祖言教授主持下，积极开展带旋髂深血管蒂髂骨瓣转位治疗股骨颈骨折及其良性肿瘤。蒋祖言、金大地教授自1981年起开展胸大肌、背阔肌转位重建屈肘、屈指功能，疗效显著。1985年黄旭东调任医教部助理员，后任医教部主任和大坪医院院长；1986年谭肇铿教授调任大坪医院副院长；1986年金大地教授调到南方医院骨科工作，后来任该科主任并成为我国骨科知名专家。
1986年骨科由林贵德副教授任主任，在吴先道教授的帮助下，开展了一系列儿麻矫正手术，如肢体延长术等。此时，该科显微外科技术日益提高，以刘晋才、王爱民教授为代表成功地完成了断离10小时以上的断指（肢）再植术，成活率达95％以上。同时开展了带血管足趾游离移植再造拇指的缺损，再植成活率达100％。并逐渐开展了全身各部位复合组织的移植，使该科的显微外科手术在西南及重庆地区处于领先地位，并已进入全国先进行列。为了进一步发展显微外科，于1988年底，骨科由40张床位增至60张床位，其中骨科组40张床位，显微外科组20张床位。显微外科组与创伤科并存于另一个病区，由蒋祖言教授主持工作。1989年开始招收硕士研究生，1990年林贵德副教授在异种脱钙骨移释放系统方面的研究获该校骨科第一项国家自然基金资助。
1991年骨科由蒋祖言教任主任，骨科技术力量进一步提升，能开展骨科各类手术。杨欣建教授成功引进脊柱Halington棒固定术。蒋祖言教授、王爱民教授成功的开展了带血管骨膜与同种脱钙骨联合移植治疗大段骨缺损、加压外固定与肢体延长术治疗胫骨骨不连骨缺损、健全神经转位治疗臂丛神经损伤、屈指肌腱鞘管麻醉的临床应用等，这些治疗技术在开展的当时都处于国内的先进行列。1992年王爱民教授受CMB资助赴香港玛丽医院骨科进修一年，1993年沈岳、杨欣建教授调到创伤中心工作。1993年王爱民教授、蒋祖言教授“屈指肌腱鞘管麻醉的临床应用”获校医疗成果二等奖，1994年王爱民教授、蒋祖言教授“六脏器MODS救治成功” 获校医疗成果一等奖。
1997年底骨科由彭学良副教授任主任，并将骨科病区化分为2个经济独立的小组：骨科组：25张床位，由彭学良副教授主持工作。显微、手足外科组：15张床位，王爱民教授主持工作，治疗范围主要是显微、手足外科外伤与疾病、股骨头无菌性坏死的病人，特色是各种复杂手外伤的处理，显微腰椎间盘摘除术，以及带旋髂深血管的髂骨瓣移植治疗股骨头无菌性坏死。期间彭学良副教授开展全膝关节置换手术，王爱民教授开展全肘关节、掌指关节和全踝关节置换手术。
2000年王爱民教授、杜全印副教授、孙红振副教授采用血管重建和保肢技术成功切除世界最大骨肿瘤并保肢成功。2001年医院决定将骨科分成2个病区：骨科病区40张床位，由由彭学良副教授任主任，创伤骨科（创伤二科）49张床位由王爱民教授任主任。
2003年骨科病区由赵建华教授任副主任并主持工作， 2002年1月，黄海洋教授赴美国留学，18个月后回国任副主任。期间骨科开展了先天性半椎体畸形，脊柱侧弯畸形矫正等手术。
2001年7月医院成立创伤专科医院，建立创伤二科（创伤骨科）病房，显微、手足外科组全体医生及原创伤科部分医生调到创伤二科工作，王爱民任主任，沈岳、杨欣建任副主任，何义平任护士长，展开床位49张。陆续开展了严重多发性骨折损害控制分步救治新技术，颈胸腰椎骨折的前路、后路手术治疗，骨盆骨折的内、外固定治疗，下腔静脉安置滤网治疗下肢深静脉血栓，关节镜和关节内骨折的微创复位和内固定手术等。2001年，王爱民教授批准为骨外科学博士生导师并招生博士研究生；2003年成功地承办了近500人参加的第九届全国骨与关节损伤大会；2003年“脉冲电磁场加速肌腱、软骨、血管和神经修复的研究”获得重庆市科技进步三等奖；2004年王爱民教授和创伤二科分别获个人和集体三等功。2003年王爱民教授招生的该科第一批博士研究生----王晓军、郭庆山并于2006年顺利毕业。
2005年医院将骨科和创伤二科合并，床位89张，由王爱民教授任主任，沈岳副教授和孙红振副教授任副主任，免去赵建华、黄海洋骨科副主任职务。骨科树立了“创伤骨科”和“人工关节”品牌，许多临床救治已经达到国内、外先进水平。如2005年王爱民教授、杜全印副教授、孙红振副教授对“1/3躯体毁损的严重多发伤救治成功”，2006年“6岁儿童严重多发伤救治成功”，2007年孙红振副教授成功首创的“前后路联合治疗Hangman骨折”，2007年人工关节翻修超过100台，人工关节置换术超过200台/年等。2006年王爱民教授主持“组织损伤修复材料关键技术研究”获重庆市科委重大课题（100万）资助，2007年王爱民教授、沈岳副教授牵头“骨关节型严重多发性损伤的救治” 评为校新业务二等甲级成果奖。2007年王爱民教授享受优秀专业技术人才三类岗位津贴。
2007年7月28日该院新病房大楼启用，骨科由骨一科、骨二科二个病区组成，王爱民教授任主任，孙红振副教授任副主任，展开床位107张。2008年5月12日纹川发生大地震后，该科在上级统一指挥下，先后有王子明、柳峰、赵建华、兰秀夫、吴思宇、廖素梅、孙红振同志赴德阳、汶川前线救治伤病员，王爱民、王雨、平自玲于5月15日从前线接回第一批伤员。骨科表现突出，骨科被评为学校先进党支部，王爱民被评为优秀党务工者，王子明、赵建华、廖素梅、荣获个人三等功，孙红振被总后嘉奖，柳峰、兰秀夫、吴思宇、王雨、刘明永获嘉奖，廖素梅获全国三八红旗手，廖素梅为重庆市第9位奥运圣火炬手，由骨科救治的灾区严重多发伤伤员刘刚均同志在王子明博士的护送下也成为了重庆市第206位奥运圣火炬手。2008年王爱民教授被评为校十佳博士导师，兰秀夫、费军二位被评为校十佳博士，2008年王爱民教授被评为院所“1135”优秀人才（第二层次）。
2010年院所党委成立骨科中心,下设关节四肢外科和脊柱外科，王爱民教授任骨科中心主任，同时兼任关节四肢外科主任，杜全印副教授任关节四肢外科副主任，赵建华教授任脊柱外科主任，孙红振副教授任脊柱外科副主任。调整后骨科毛收入超亿元，获教学先进集体。关节四肢外科手术数量居全院第一、获先进集体和优秀科主任(王爱民)、医保管理先进科室、安全稳定达标单位。
2014年门诊超8万人次，住院和手术双双超过3000，成立市第一家“运动医学与关节微创门诊”，关节四肢外科为全院外科医疗质量唯一全面达标科室，平均住院日9.36天，为全市最低，骨科毛收入超2亿元，廖淑梅护士长召开全市第一个骨科护理大会。
