围产儿外科是重庆市妇幼保健院围产医学中心建设的关键科室之一。科室分为胎儿外科、新生儿外科和小儿外科三个亚专业组。
胎儿外科:科室始建就完成了胎儿宫内治疗难度最高的手术:胎儿镜下气管封堵术治疗先天性膈疝。同时也陆续开展了胎儿镜下胎盘血管激光凝固术治疗双胎输血综合征等多种胎儿外科手术。重庆市妇幼保健院围产儿外科是国内为数不多能开展全系列胎儿宫内治疗技术的中心之一。
新生儿外科和小儿外科:以新生儿及小儿胸腹部疾病为诊疗特色,如:先天性膈疝、肺囊腺瘤、肠道闭锁等。在微创治疗新生儿及小儿疾病有丰富的临床经验,如胸腔镜下膈疝修补术、腹腔镜下十二指肠菱形吻合术等。