口腔科位于门诊B区3楼。目前拥有专业技术人员28人，其中主任医师2人，副主任医师9人，主治医师7人，住院医师2人，护师2人;含博士研究生3人，硕士研究生11人。拥有口腔综合治疗椅29台，配备Leica显微镜、ProMax CBCT、XD-2半导体激光、CAD/CAM椅旁数字化系统等先进设备。门诊中心细分牙体牙髓、牙周、口腔正畸、口腔种植、口腔修复、儿童口腔、口腔颌面外科等亚专业。常规开展显微根管治疗、显微根尖手术、牙髓血运再生、牙再植技术、隐形矫正技术、正颌正畸联合治疗、DSD前牙美学修复、数字化种植修复等前沿技术；与医院其他科室共同协作，组成多学科治疗MTD团队。
口腔科正畸诊疗组主要治疗儿童、青少年及成人牙颌面畸形的专业诊疗机构诊治范围包括：各类牙列不齐，反（牙合），开（牙合），上颌前突，下颌后缩，双颌前突，露龈微笑等各种错牙合畸形，以及错牙合畸形的早期治疗，正畸正颌联合治疗，牙周病的辅助正畸治疗，唇腭裂的正畸治疗，种植、修复前的正畸治疗等。我们在全省率先开展了儿童颜面管理多学科联合治疗，口腔颌面部精细化多学科联合治疗。多学科联合诊疗组包括口腔科、耳鼻喉头颈颌面外科、儿科，呼吸与危重症医学科、放射科等多位专家，针对儿童腺样体肥大、扁桃体肥大、鼻炎导致的颜面问题（如腺样体面容，上唇外翻，“龅牙”等）及阻塞性睡眠呼吸暂停综合征等问题进行多学科联合的综合治疗，为颜值和健康保驾护航。我科还是福建省开展正畸正颌联合治疗的极少数医院之一，目前已开展近百例，对骨性错颌畸形严重的成人患者，通过正畸正颌联合治疗，有效解决了骨性畸形。正畸诊疗组还开展由咬合紊乱引起的咀嚼痛、颞颌关节痛等关节问题的正畸治疗。
牙体牙髓儿牙诊疗组由牙体牙髓专业及儿童口腔医学专业医师组成，引进国际顶尖的显微放大系统，包括人手一副、量身定制的意大利UNIVET(优尼威)带镜架双筒放大镜、德国Leica 显微镜，以及德国VDW根管马达、德国VDW生产的EDDY声波荡洗等根管治疗操作系统。常规开展显微根管治疗、显微根尖手术、意向性牙再植术、牙髓血运重建术等牙体牙髓前缘技术，尽最大努力为患者保留每一颗患牙。逐步开展非药物性行为诱导下的儿童口腔治疗。
牙周诊疗组经十余年不断完善，已形成专业团队。科室陆续引进EMS、DENSPLAY、VECTOR、啄木鸟等牙周超声治疗仪，佛罗里达电子探针、显微外科手术器械等专业设备。目前可以开展牙周基础治疗、各种牙周手术、维护治疗等牙周诊疗工作，且为口腔科其他专业乃至全身其它疾病的诊治提供强有力支撑。
口腔齿槽外种植修复专科包含种植修复及齿槽外科两个亚专科。科室引进国际顶尖的牙种植系统，包括瑞士Straumann种植系统，美国Zimmer种植系统。同时配备一流的种植机、手术设备，成功开展前牙美学种植、即刻种植、上颌窦提升术、各种复杂骨增量术、无牙颌All-on-6等种植修复技术。同时与耳鼻咽喉头颈外科配合，开展颌面部肿瘤术后颌面部缺损复杂种植修复；齿槽外科主要负责各类口腔外科门诊手术手术，包括：1.快速微创拔除各类复杂成人、青少年继儿童埋伏阻生牙或骨融合牙；2.义齿修复前手术：牙槽骨修整术，系带矫正术，骨隆突修整术，上颌结节肥大修整术，唇颊前庭沟加深术；3.其他手术包括：粘液腺囊肿切除术，舌下腺导管结石摘除术，牙龈瘤切除术，恒牙助萌术等。
口腔修复专科负责各类牙体缺损、牙列缺损及牙列缺失的修复诊治，常规开展口腔固定修复术、活动义齿修复、全口义齿修复、DSD前牙美学修复、肿瘤术后伴各类骨缺损的赝复体修复等技术。数字化诊疗技术是口腔修复发展的趋势，我科成立了口腔数字化工作室，配备有先进的CAD/CAM椅旁数字化系统，可行椅旁嵌体、贴面、临时修复体、种植导板等制作，大大提高了临床工作效率，减少了患者的就诊次数。
口腔颌面外科住院病区设置于耳鼻喉头颈外科住院部，拥有床位30张，年手术量约800台，开展包括唇腭裂序列治疗、颅颌面部骨折诊治、头颈部肿瘤个性化治疗及正颌外科治疗等专业。口腔颌面部显微外科手术量居厦门首位，处于福建省领先水平。
在医院领导的统一部署和多方关心支持下，口腔科励精图治、发展迅猛，获得国家自然基金、福建省自然科学基金、厦门市自然科学基金、厦门市科技计划项目等多项科研课题立项，发表SCI论文十余篇、国家核心期刊三十余篇，2016年厦门市医学创新奖、2017年厦门市科技进步奖三等奖，2019年获福建省修复病例大赛最具潜力奖，2022年获全国种植BITC大赛三等奖，成绩斐然，前景广阔，综合实力跻身福建省口腔行业前列。
作为厦门市首批国家规范化培训基地之一，科室不仅承担本科及以上学历毕业生的规范化培训，还承担了福建医科大学口腔医学院实习生带教、厦门大学医学院口腔系授课、厦门医学院口腔医学系授课等教学任务，为福建省口腔医学专业培养大量优秀人才。在厦门卫健委主导的2019年艾力彼厦门医院综合实力评估及专科实力评价中，我院综合实力排名第一，综合医院口腔科排名第一。
