厦门大学附属中山医院呼吸内科坐落于厦门美丽的筼筜湖岸边的医院3号楼内，住院病区设置两层楼120张病床、呼吸重症监护病房（RICU）12张病床、睡眠呼吸监测中心6个独立单间、呼吸内镜-肺功能综合诊疗部800M2、呼吸实验室3间及药物临床试验（GCP）区；呼吸门诊5间（普通门诊2间，专家门诊3间）。现有在岗医护人员90余人，其中医生20余人，高级职称6人，博士4人，硕士12人。有教授、研究生导师及享受国务院政府特殊津贴专家。病区设有五个医疗组和三个护理单元（包括一个重症护理单元）。科室承担厦门大学医学院和福建医科大学本科生（包括外籍生）的临床教学和研究生的培养。是集医疗、教学、科研及预防为一体的临床主干科室，是“国家住院医师规范化培训基地”，“国家药物临床试验基地”，“中国呼吸道感染优化治疗协作组”和“全国肺栓塞防治协作组”成员单位。

科室规模庞大，配套完善；布局巧妙，硬件领先；设施超前，功能齐全；服务优质，医疗规范；恪尽职守，业务精湛；环境优美，堪称景苑。

科室开放呼吸普通专科门诊2间，呼吸专家门诊3间，气道吸入治疗室一间(雾化治疗，干粉吸入器示教)。另开设 “哮喘专家门诊”，“肺部肿瘤门诊”，鼾症门诊和戒烟门诊等专病门诊，年门诊量6万余人次。

呼吸内科住院病区设有两层楼（两个病区），总面积4600 M2，设定总床位120张（每个病区均设有单人VIP、双人间、三人间及四人间等不同规格的房间），年出院病人4000人次左右。病区分为五个医疗组和三个护理单元（包括一个重症护理单元）。每个病区配套齐全，除了医生办公室、病区护理站等多间医疗及配套用室外，还设有多媒体中控功放投影示教室。

病区设有RICU，面积300多 M2，内设带有吊桥的日本原装电动可控多功能病床12张（包括1间重症VIP隔离房间），其内设有中央监护台、医生办公室、治疗室、支气管镜洗消室及其附属设施；拥有瑞士产（金型）伽利略、美国泰科新型PB840、德国产新型德尔格Evita-4和西门子新型Servo-i等一批高档有创呼吸机以及不同厂家的进口无创呼吸机（一次性购进飞利浦伟康Thtogy 100型无创有创两用呼吸机8台）和监护仪。

病区设独立的、全配套并配有独立卫生间的单间监测病房6间，医生监测工作室1间，每间均按国际标准建成隔音墙壁，红外线监控和对讲系统，配备澳大利亚Compumedics（康迪）无线遥距睡眠监测系统（高清晰76导睡眠监测仪6台）。每间配有操作台（监测线储藏柜）、液晶电视及茶几等附属设施。主要是对睡眠障碍疾病的诊治和研究，进行多导睡眠图（PSG）监测（分型、疾病的严重程度及睡眠障碍疾病的鉴别，评价各种治疗手段对OSAS的疗效）、压力滴定、持续无创气道正压通气（CPAP）治疗、并发症的排查以及康复指导等。

科室附设800多M2的现代一体化的呼吸内镜-肺功能综合诊疗部，内设支气管镜术前麻醉准备间、呼吸内镜检查室3间、呼吸内镜洗消中心、镜柜室及医生办公室。配备日本产支气管镜诊治系统5套(其中奥林巴斯荧光电子支气管镜1套)，奥林巴斯内科电子胸腔镜1套；德国爱尔博（ERBE） VIO200S+APC2型呼吸内镜氩气刀1套，德国爱尔博（ERBE）CA型多功能冷冻治疗仪，上海维世康MTC-3A型微波治疗仪。设有肺功能检查室2间（运动心肺检查室1间），肺功能雾化室1间；配备价值170余万元的全球最先进、最新型、高级组合模块式、数字化并可无限升级的全配套（包括体描、运动等）的德国原装进口的JAEGER（耶格）专业肺功能检测系统；有初、中级两名专职从事肺功能的临床医生；年肺功能检测近万例次。设有呼吸内镜和肺功能示教室（装备辐射支气管镜和肺功能各个检查室的红外线摄像系统和多媒体投影）。内设资料室1间及其他附属设施。

设有独立的呼吸实验室3间和设备仪器间。配备先进的科研试验仪器，有日本尼康Eclipse 80i生物显微镜、德国LEICA EG 1150H,LEICA EG 1150Ｃ自动石蜡包埋系统、德国Leica RM2245半自动转轮切片机、美国GeneAmp PCR System 9700基因扩增仪、德国Hettich离心机MIKRO 220R及美国Thermo Fisher超低温冰箱revco Value系列 ULT1386-3-V42)等。

病区设有药物临床试验（GCP）办公室、GCP药品室、GCP资料室及谈话室。常年接收国际和国内多个GCP研究项目，几乎所有研究项目的入组人数均位于国内多家研究中心之前列，其中多个项目入住人数位居第一名。

科室招收培养厦门大学医学院和福建医科大学两校呼吸学术型和专业型研究生。承担厦门大学医学院（包括外籍生）和福建医科大学部分临床医学专业本科生的呼吸诊断和呼吸内科学的临床理论、见习和实习课等教学任务。承担厦门大学医学院护理系，福建医科大学护理学院护理本科生和厦门医高专护理专科生的理论、见习和实习课等教学任务。

科室近几年来，独自成功地承办了由中华医学会继续教育部及中国医师协会培训部主办的“中华医学会全国呼吸衰竭诊治新进展研讨会”，“ 中华医学会全国呼吸研究新进展与临床应用研讨会”，“ 中华医学会全国感染疾病研究新进展与临床应用研讨会”，“中国医师协会全国呼吸疾病学术研讨会”，“睡眠中心标准化建设国际培训班”等多次全国学术会议暨培训班。

急慢性支气管炎、支气管扩张症、肺部感染性疾病、支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病、肺动脉高压与急慢性肺源性心脏病、肺部良恶性肿瘤、肺血栓栓塞症、间质性肺疾病与结节病、职业性肺疾病、肺免疫和变态反应性疾病、风湿病肺部表现、成人肺部先天性疾病、胸膜疾病（良恶性胸腔积液、气胸、胸膜肿瘤）、纵隔疾病、睡眠呼吸暂停低通气综合征、急性呼吸窘迫综合征、急慢性呼吸衰竭；诊治呼吸系统各种疑难病、危重病及少见病等等。对支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病（COPD）、肺血栓栓塞症和呼吸道感染等疾病，分别按照哮喘防治全球创议（GINA）、慢性阻塞性肺疾病防治全球创议（GOLD）、全国肺血栓栓塞规范化诊疗方案及中国呼吸道感染优化治疗方案等相关指南进行规范化诊治。此外，科室定期组织患有呼吸系统常见慢性疾病（如哮喘、COPD及鼾症）及高发病（如肺癌）的患者进行健康知识宣教活动。科室在“非典”、“人禽流感”及“甲流”等呼吸道疾病疫情中做出了突出贡献，受到国家、省、市的表彰。

科室配备了12张独立的呼吸重症监护病房，诊治各型呼吸衰竭及各种呼吸危重症患者；引进6台最高档睡眠监测仪（76导高清），开展鼾症（包括睡眠障碍疾病）的诊治和临床研究；配备了荧光电子支气管镜、内科电子胸腔镜、氩气刀、内镜冷冻仪及微波治疗仪等全套呼吸内镜介入设备，开展支气管镜介入诊治新技术，包括球囊扩张、支架置入、经纤支镜肺活检、经支气管镜针吸活检及肺泡灌洗；经内科电子胸腔镜诊治胸膜疾病；胸膜活检术及胸膜固定术；引进耶格全套肺功能检查系统（包括体描及运动检查等），进行全部肺功能项目检测；开展呼吸末CO2检测以及肺癌的分子靶向治疗的研究等。

科室荣获“抗击非典特殊贡献奖”、“科室质量管理先进集体” 、“科室管理先进集体”、“医药费用控制管理先进集体” 、“先进基层党组织”、“临床教学工作先进集体”、“护理质量管理先进集体”、“护理教学先进集体”、“护理岗位技能竞赛优秀组织奖”等集体奖项。在非典肆虐时期，该科成功抢救治愈了全省最重一例非典患者，受到中共中央组织部，共青团中央，全国总工会，省委省政府，市委市政府的表彰和奖励。国务院非典督查组组长欧新黔和原福建省委书记、省长卢展工等领导曾来访该科。原中华医学会会长，中华医学会原呼吸病学分会主任委员，中国工程院院士钟南山教授于2002年4月和2009年10月先后两次莅临该科视察。