儿科，分为一病区、二病区。
一病区位于住院部南区6楼，是市级临床重点专科、山东省立医院儿科联盟单位、山东医师协会儿科呼吸联盟成员单位、山东省立医院儿科急危重症专科联盟成员单位，是集医疗，科研、教学、预防保健为一体的综合科室。
开放床位50张，现有医护人员23人。医生10人(副主任医师3人、主治医师1人、住院医师6名)，护理人员13人(副主任护师1人、主管护师6人、护师4人、护士2人)。多名医护人员先后在省级以上医院(齐鲁儿童医院、山东省立医院儿科等)进修深造，每年选派人员参加全国儿科培训班学习。
2011年开展脑电图检查，2014年开设家庭雾化室，2016年院内首个开展儿童肺功能，2019年开展儿童一氧化氮检测，2020年开设儿童哮喘门诊，开展食物特异性IGG抗体检测，建立规范的哮患儿管理模式。
在各种喘息性疾病、肺炎、热性惊厥、幼儿腹泻、心肌炎、各种病原引起的脑炎、脑膜炎、手足口病、麻疹等疾病的诊治方面积累了丰富的临床经验，尤其是社区获得性肺炎、过敏性紫癜及疑难病例诊治方面有独到之处，在周边县市处于领先地位，取得了良好的社会效益，得到了社会各界人士的一致好评。
儿科二病区位于病房南区7楼，系庆云县新生儿危急重症救治中心、德州市临床重点专科、市医联体单位、山东大学齐鲁医院儿童内分泌生长发育专科联盟成员单位。
现有医护人员28人，其中主任医师1人，副主任医师1人，主治医师3人，住院医师7人;主管护师7人，护师3人，护士6人。开放普通床位36张，NICU床位16张，主要承担全县及周边地区儿童及新生儿疾病的诊疗工作。
科室配备先进、功能齐全，除开展儿科及新生儿、早产儿常见业务外，还开展新生儿及儿童神经行为测评,脑瘫患儿的康复治疗指导及儿童保健业务。儿科二病区全体医护人员始终以精湛的业务水平，优质文明的服务，全心全意为广大患儿的健康成长做出贡献。
