新疆维吾尔自治区人民医院神经内科成立于1985年。共有医务人员70余人。神经内科有普通门诊和专家门诊，门诊设在门诊大楼的3楼。周1,3,4设3位专家门诊，周2，5设2位专家门诊。病房设有两个病区。分别在急救综合大楼21层和22层。目前属于新疆自治区规模最大的神经内科。
该院神经内科在脑血管病的诊断治疗方面具有丰富的临床经验。从2008年4月起，建立了神经内科的“卒中门诊”，该门诊设在急救综合大楼一层，专门针对卒中-即“急性脑血管病”设立了诊断治疗的绿色通道，为为卒中患者及时正确的诊断和治疗奠定了基础。急性缺血性卒中的患者往往需要在发病以后3小时内得到及时的溶栓治疗，但是当患者到医院就诊时，常常已经耽误了很多时间，卒中门诊的建立，就是保障患者在到达医院之后，立即得到准确的诊断和及时处理，减少患者因为挂号，排队，预约等延误的机会。卒中门诊建立以来，已经有许多患者获益。
神经内科在学科建设方面，除了脑血管病之外，还有其他许多优势。感染性疾病，重症肌无力，格林巴利综合症，癫痫，多发性硬化，帕金森病运动神经元病等，均是该院神经内科主要诊治的疾病，具有多年的临床经验。神经内科对于头痛，眩晕的诊断治疗还有独特的优势。近年来，越来越多的疑难疾病患者到该院神经内科就诊，反映该科医疗水平已经得到患者的广泛认可。
神经内科具有本学科的辅助科室。脑电图室具有四台美国进口视频脑电图仪，其中一台为128导，三台为32导。另外还拥有一台普通脑电图仪和一台动态脑电图仪。脑电图主要运用与发作性疾病的诊断和鉴别诊断，如癫痫。需要将偏头痛，脑血管病，发作性睡病和癔病等疾病鉴别出来。另外要明确癫痫发作的类型，属于什么综合征，为临床治疗提供依据。近年来，配合神经外科进行癫痫患者的手术监护，取得了满意的效果。
神经内科肌电图室具备两台肌电诱发电位仪。均属高性能的美国进口设备。目前能够进行常规的肌电图检查和诱发电位检查。主要用于周围神经病和肌肉疾病的诊断和鉴别诊断。常见的周围神经病有糖尿病周围神经病，格林巴利综合症，颈椎病或腰椎间盘突出引起的臂丛，腰骶丛神经压迫等。常见的肌肉疾病包括肌炎，肌营养不良等。还开展了单纤维肌电图的检查方法，对于重症肌无力的诊断发挥了重要作用。近年来，神经内科配合神经外科和骨科，在新疆率先开展了颅内手术和脊柱手术的术中电生理监护，有效的减少术中神经的损伤，提高了手术质量。
在神经内科具有自己的脑脊液细胞学室，从脑脊液细胞的数量和构成的变化诊断脑和脑膜等疾病，如对结核性脑膜炎与化脓性脑膜炎的鉴别，发现肿瘤细胞，评价抗炎治疗的效果。脑脊液细胞学结合影像学检查对于颅内(脑)的疾病诊断发挥了重要的作用。
神经内科还建立了神经病理实验室，主要用于肌肉疾病的诊断和鉴别诊断，当患者出现肌肉无力，肌电图反映肌肉疾病的时候，进行进一步的病理检查，能够明确肌肉疾病的性质，如多发性肌炎，皮肌炎，酒精性肌病，线粒体肌病等。
神经内科与其他兄弟科室建立了密切的协作关系，使患者在该院得到高质量的服务，如CT室，核磁共振室，中医科，理疗科，疼痛科和康复科等，许多少见疾病得到及时的诊断和处理。卒中患者可以在神经内科住院期间，得到中医，针灸，理疗和康复等多元化治疗，使治疗效果得到进一步提高。
