消化内科中心是我院第一批专科中心，创建于1987年，为福州总院的重点学科，是我院消化系统疾病的医疗、教学、科研和预防保健中心。为国家药物临床试验基地。医疗技术力量雄厚，现有工作人员85人，其中高级职称7名，中级职称10名，博士学位6名，硕士学位12名。消化内科中心包括消化门诊、病房（消化内科一区、消化内科二区）、消化内镜中心、第二住院部胃镜室4部分。现病房展开床位84张，年收容住院3000余人次；年门诊量近10万人次；消化内镜中心是福建省内设备最先进、技术力量最强的内镜中心之一，拥有5间诊疗室及现代化的内镜清洗消毒工作间，实现每人一次完整内镜消毒，院内定期进行消毒质量检测。拥有消化道电子内窥镜主机6套，配备电子胃镜、电子肠镜、电子十二指肠镜、超声内镜、胶囊内镜、双腔治疗内镜、放大内镜等目前国内外最为先进的内镜，开展ERCP治疗、超声内镜、内镜下各种治疗、无痛内镜、术中内镜检查等先进诊治项目，累计内镜诊疗约30000余例次/年，其规模和实施在省内和国区内均属一流水平。
消化中心主要从事消化系统疾病的诊断与治疗，包括胃食管反流病、食管癌、贲门失迟缓症、急性胃炎、慢性胃炎、胃十二指肠溃疡、胃癌、上消化道出血、肠炎、溃疡性结肠炎、克隆氏病、胃肠息肉、急性胰腺炎、肝硬化、胆囊炎、胆囊结石、胆总管结石、肠癌、胰腺癌等的诊断和治疗。于2011年开设了福建省首家胃食管反流病专科门诊和胃食管反流病诊治中心，在国内同领域居先进水平，吸引了许多省内外患者就诊。消化系疾病的内镜诊断和治疗也是本科室的优势医疗项目，可开展消化道早癌和癌前病变的微创治疗、胆道结石内镜下取出、消化道出血紧急止血、消化道支架置入、经皮胃内镜下造瘘术、贲门失弛缓症内镜治疗等各种先进技术。
消化内科中心开展了较好的科研和教学工作。科研主攻方向有：胃食管反流病的基础与临床研究、非酒精性脂肪肝的研究、早期胃癌和食管癌的诊治研究、结肠息肉病的治疗研究等。在SCI期刊、核心期刊及统计源期刊等各级刊物发表论文500余篇，获福建省科技二等奖、医疗成果一等奖、技进步三等奖等7项，承担多项省部级重点科研课题。每年多人参加国际国内学术交流并作会议专题报告、论文报告、内镜示范表演等。消化内科注重培养各级医学人才，为厦门大学、福建医科大学、安徽医科大学、福建中医院大学等高校的教学临床医院、硕士研究生培养点，承担本科生课程及临床实习带教任务，完成硕士研究生培养工作，另长期培养教学进修医生、规培轮转医生。
科室近年来积极进取，与时俱进，不断学习国际、国内的先进理念，先进技术，结合我科自身优势与特点，开展了特色新技术和新业务，包括：
1、 胃食管反流病治疗：成立了胃食管反流病专科门诊和胃食管反流病诊治中心，开展了食管pH阻抗联合检测及食管pH胶囊检测，控制食管炎、反酸、烧心等症状处于国内领先和国际先进水平。
2、消化道肿瘤诊治：利用内镜染色技术、放大内镜、超声内镜等先进手段，明显提高消化道早癌的诊断率，对于“一点癌”、原位癌、早癌进行粘膜大块切除等内镜下治疗，减少了手术创伤和费用。对于进展期肿瘤患者，术后进行个体化方案化疗，有效控制肿瘤复发和转移，明显延长了患者的生存时间，提高了生活质量。
3、内镜下逆行胰胆管造影（ERCP）术：目前开展胆道括约肌切开取石及胆管良恶性狭窄的扩张、胆道支架置放术等
4、超声内镜及超声引导下穿刺活检术：为明确诊断、指导治疗提供了可靠依据，明显提高了粘膜下肿物、粘膜早癌、胰腺微小占位的诊断率。
5、消化道大出血内镜下治疗：如局部注射止血、金属钛夹止血等。
6、消化道狭窄内镜治疗：食管良恶性狭窄临床较常见，我科开展了食管狭窄的硬式及球囊扩张、金属支架置入等治疗技术，积累了丰富的临床经验。
7、食道静脉曲张的内镜下硬化剂注射和套扎治疗；
8、消化道各种异物的取出、息肉的切除；
9、小肠疾病内镜诊治：开展了国产及进口胶囊内镜；
10、无痛胃镜、肠镜检查：无痛内镜实现内镜检查无恐惧、无痛苦，基本是在睡眠中完成内镜检查，实现了内镜检查的人性化服务、深受病友欢迎。
