功能神经外科（神经外科）始建于1961年，1997年被山东省卫生厅授予山东省特色专科，2008年成为卫生部颅内血肿微创清除术协作医院，2010年成为卫生部颈动脉内膜剥脱术推广医院、成立济宁医学院神经外科研究所，2011年成为省级继续医学教育项目培训基地，2013年成为国家级继续医学教育项目培训基地。
2014年被评为山东省临床重点专科，2017年被授予鲁西南脑血管病医学中心，2018年成为国家神经系统疾病临床研究中心联盟成员单位，2019年成为全国三叉神经痛面肌痉挛微血管减压手术推广应用基地，2020年被评为山东省神经专科区域医疗中心，2021年被国家卫健委评为神经介入建设中心，2022年被国家卫健委评为脑出血外科诊疗基地，2023年被国家卫健委评为神经外科建设中心、被中国抗癫痫协会评为国家二级癫痫中心、成立济宁市医学科学研究院中枢神经血管损伤与修复研究所、获批济宁市脑卒中与神经修复重点实验室。
神经外科现有6个病区（神经外科东院肿瘤病区、血管病区、功能病区、重症监护室和总院病区、西院病区，设置床位228张），1个研究所（济宁市医学科学研究院中枢神经血管损伤与修复研究所）、1个实验室（济宁市脑卒中与神经修复重点实验室）；目前科室是山东省医师协会神经外科医师分会副主委单位、山东省医学会创伤外科学分会副主委单位，济宁市医学会神经外科学分会、济宁市医学会神经介入分会主委单位，济宁市神经外科质控中心挂靠单位。
科室诊疗病种涉及脑肿瘤、脑脊髓血管、功能神经疾病、脊柱脊髓、创伤重症等疾病。科室现有医生54人、护士80人，其中主任医师9人，副主任医师15人，主治医师23人，有博士4人，硕士44人，硕士研究生导师7人，国外访问学者4人，济宁市拔尖技术人才、济宁市有突出贡献的中青年专家、山东省优秀医师、山东省优秀科技工作者等称号5人。
专业设备齐全，配有神经导航系统1台、德国蔡司KINEVO900（三荧光）、PENTERO900(双荧光)、TIVATO700（单荧光）等高端手术显微镜4台、德国产蛇牌、日本NSK铣刀、气、电磨钻、双极电凝、超声外科吸引系统（CUSA）、STORZ神经内镜、神经电生理监测仪、经颅彩色多普勒超声诊断仪（TCD）、立体定向仪，脑深部电刺激控制器、128导移动移动式视频脑电、颅内压力和温度监护仪、神经外科头架固定系统、Philips大型平板数字减影血管造影机及数字成像系统、GE全新一代的双向数字平板（双C臂）血管造影系统、血流动力学监测系统、血气分析仪、亚低温治疗系统、呼吸机、纤支镜、中央监护系统等设备。
近3年，科室主持山东省自然科学基金项目1项，山东省卫生医药项目3项，济宁市重点研发项目4项，先后在国内外核心期刊发表文章40篇，期间先后指导山东第一医科大学、济宁医学院硕士研究生8名；承担国家级、省级医学继续教育项目6项，举办全国、省市级学术会议15次；承担山东第一医科大学、济宁医学院等院校本科生见习、实习带教任务。
科室年门急诊量约32000人次，年出院患者4000余人次，年手术患者约2400人次，综合实力位居鲁西南地区前列。
科室专业情况：
神经外科肿瘤专业：主要从事脑膜瘤、胶质瘤、听神经瘤、胆脂瘤等颅内肿瘤手术切除术、经鼻蝶内镜下垂体瘤手术等；
神经外科血管专业：主要从事脑、脊髓血管疾病的血管内介入与显微外科手术治疗，包括脑动脉瘤、脑动静脉畸形（瘘）、颈、椎动脉狭窄、颅内静脉窦血栓形成、脊髓血管疾病等；使用颅内外血管搭桥技术治疗颅内巨大动脉瘤、烟雾病及缺血性脑血管病，脑出血精准微创手术。
神经外科功能专业：主要从事三叉神经痛、面肌痉挛的微血管减压手术，三叉神经射频电凝及球囊压迫手术，帕金森病、癫痫、梅杰综合征等脑深部电极植入（DBS）手术等。
神经外科重症专业：主要涉及神经外科各类重大手术围手术期管理、重症脑出血、重型脑外伤及颅内感染重症患者治疗等。
神经外科脊柱脊髓专业：主要从事颅颈交界区肿瘤、髓内肿瘤、脊膜瘤、神经鞘瘤、脊柱肿瘤切除术，小脑扁桃体下疝畸形、脊髓空洞、寰枢椎脱位、颅底凹陷等颅颈交界区畸形手术。
科室主要技术：
1、开展颅内及椎管内各部位的肿瘤切除术、脑胶质瘤规范化治疗；
2、岩前入路岩斜脑膜瘤切除术、内镜下垂体瘤切除术、内镜控制下脑室内肿瘤切除术；
3、颅颈交界区畸形、脊柱脊髓疾病的外科手术治疗；
4、三叉神经痛、面肌痉挛等颅神经疾病的显微血管减压术，三叉神经痛球囊压迫术等；
5、脑深部电极刺激术治疗顽固性癫痫、帕金森病、梅杰综合征、痉挛性斜颈，热凝毁损术治疗癫痫等；
6、脑血管病（脑动脉瘤、动静脉畸形、动静脉瘘、动脉狭窄）的显微外科手术及血管内介入治疗；
7、内膜剥脱术或支架植入术治疗颈动脉狭窄；
8、颅内外搭桥技术治疗烟雾病、脑动脉狭窄和颅内巨大动脉瘤等；
9、急性脑梗塞、颅内静脉窦血栓形成的急诊介入治疗；
10、重型颅脑损伤和高血压脑出血手术治疗；
11、颈7神经根移植术和周围神经减压手术。
