贵州医科大学第三附院感染科暨（黔南州传染病医院）是黔南州传染病定点收治医院，从1981年建科至今，历经发展39年，科室多次承担黔南州突发公共卫生事件的处置，先后参与1998年黔南州的霍乱防治，负责收治重症病例及住院患者治疗工作；2003年我州防治SARS工作全面打响，我科承担了疑似、确诊SARS患者的排查及救治工作;2006年我科率先在黔南州开展AIDS的临床诊治工作；2009-2010年承担黔南州防治甲型H1N1流感的全面排查和救治工作，共诊治发热病人2300余例；2011年成为全州重症手足口病定点救治单位，共收治约2000余例患儿，2017-至今承担黔南州H7N9流感的全面排查工作；2020年为贵州省新型冠状病毒肺炎定点救治医院并承担黔南州新型冠状病毒肺炎核酸检测及疑似患者排查工作；

感染科2017年7月获得“国家临床重点专科建设培育项目”为黔南州首次；同年11月获得“黔南州艾滋病质量控制中心单位”及黔南州“重症结核、耐多药结核”定点医院。

人力资源方面科室有医、技、护人员共50余人。教授、硕士研究生导师1人，主任医师2人、副主任医师1人、主治医师3人、住院医师9人、主管护师2人，护师8人、护士28人，中心实验室有副主任技师1人、技师3人。

感染科设置床位100张，有结核病区、肝病病区、艾滋病病区、感染病区、感染科重症监护室及负压病房，公安特殊病房以及HIV感染抗病毒治疗等门诊。另有503公安特殊病院1栋，建筑面积约5200平方米，开放床位180张。

黔南州传染病医院包括：感染科病区、公安特殊医院病房，黔南州传染病医院中心实验室，综合用楼2栋，共有5层业务用楼，为独立院区。同时黔南州传染病院公安特殊医院及公安特殊病房病区主要集中收治全州患病无法处理的强制戒毒人员及刑事犯罪的患者，让众多吸毒人员得到妥善安置，从而为我州构建和谐社会和维持社会安定作出了巨大贡献。

黔南州传染病医院中心实验室设有多重耐药结核分枝杆菌实验室、微生物实验、分子生物实验室、HIV实验室、免疫室等专业实验室，拥有罗氏电化学发光仪CoBasE411、化学发光免疫分析仪、ABI7300Plus荧光定量PCR分析仪、CO2培养箱、基因芯片杂交仪、扫描仪、恒温扩增微流控芯片核酸分析仪、自动化血培养和微生物鉴定药敏分析仪等目前省内先进仪器，开展先进项目包括多重耐药结核分枝杆菌监测、手足口病毒-PCR检测、耳聋基因检测、呼吸道病原菌快速检测等，于2017年初已正式逐步开展了工作。

目前专科业务发展方向主要有以下几个方向：耐多药结核并重症结核的规范化诊治、艾滋病的抗病毒及机会性感染的治疗、病毒性肝炎的抗病毒治疗、重型肝炎及肝硬化的治疗、发热原因及抗生素合理应用等规范化治疗。能开展肝穿刺活检术、肝囊肿无水酒精栓塞术、并在病毒性肝炎、酒精肝、自身免疫性肝病、肝豆状核变性的诊断、腹水浓缩回输治疗、肝穿刺、间充质干细胞治疗各类肝硬化、肝衰竭疾病等肝脏疾病等肝脏疾病和肺部疾病新的诊疗技术。

科室多次荣获院“青年文明号”“先进集体”单位。