妇科创立于1985年，1995年经市卫生局批准设立“妇女不孕症治疗中心”。现有专科医师5人,其中4人为高级职称。该科注重传承、善于创新，目前已成为一支技术过硬具有较高业务水平的优秀团队。科室拥有先进的医疗设备、有设施完备的病房。 该科主要根据中医辨证论治、采用补肾调周的方法治疗不孕症、月经失调;中药口服、热敷、中药灌肠等中医特色疗法，治疗盆腔炎、附件囊肿、宫颈炎;补肾、活血等治法治疗痛经、乳腺小叶增生、子宫内膜异位症等妇女常见病、多发病、及部分疑难杂症。科室常规开展输卵管通畅试验—输卵管通液检查、子宫输卵管碘油造影检查；卵巢功能检查—BBT、B超监测排卵、女性激素测定、免疫因素检查、女性肿瘤指标、宫颈癌筛查等项目。采用x线下输卵管介入治疗输卵管阻塞性不孕症创伤小，成功率高，配合中医药的治疗受孕症率明显提高。该科不孕症总治愈率为70%以上（排除器质性不可逆转疾病外），LEEP刀技术治疗宫颈炎，疗效显著。在淮安、盐城、扬州等周边地区都有一定声誉。

产科成立于1983年，建科以来一直坚持以“大医精诚 病人至上”作为建科理念，一直是省级爱婴医院、医院临床重点专科。科室设有门诊诊室2个，开放床位40张。现有副主任医师3名，主治医师2名，住院医师2名，是一支人才聚集、技术过硬、具有很高业务水平的优秀团队。 该科室近年来不断加大医疗设备投入，先后购入了高清腹腔镜（微创）、阴道镜、阴道彩超、微波治疗仪、产后康复仪、LEEP刀、药物离子透入治疗仪等专科诊疗设备。科室发展迅速，全年开展手术1000余台，其中微创手术占比30%以上。能够常规开展腹腔镜下子宫（次）全切除术、宫外孕、卵巢囊肿剥除、附件切除、子宫肌瘤剥除等和阴式子宫切除等微创手术。同时继续保持剖宫产、子宫附件等开腹手术和接产、计划生育四项手术等传统手术优势。 该科室常年与淮安一院、淮安二院等上级医院保持着良好的长期协作关系。经过30余年的不懈努力，现已发展成为技术雄厚，在周边县市处于领先水平的特色专科。