二科分为一科和二科。
儿一科：
沛县中医院儿一科为院重点专科，现有医护人员20余人，8名医生，其中高级职称2人，中级职称5人，初级职称1人，硕士研究生1名；18名护士，其中中级10人，初级8人。
病房在内科楼二楼，床位设置60张，拥有新生儿科和儿内科两个病区。主要收治新生儿、各种感染性疾病（急性上呼吸道感染、支气管炎、肺炎、毛细支气管炎、脑炎、病毒性心肌炎及、败血症等）及非感染性疾病（过敏性紫癜、肾炎、肾病综合征等），其中新生儿科有陪病床位20张，拥有6台暖箱，3台蓝光治疗仪，其中一1台移动蓝光机和2台双面蓝光机，4台婴儿高压氧舱，5台心电监护仪，1台新生儿辐射抢救台，主要收治早产儿、新生儿疾病，包括：新生儿肺炎、新生儿缺氧缺血性脑病、新生儿脐炎、新生儿呼吸窘迫综合征、新生儿贫血、新生儿出血症、新生儿黄疸及小婴儿肺炎等。同时拥有1台肺部多频振动仪，1台神灯照射机，对支气管肺炎、大叶性肺炎的炎症吸收有着很好的疗效。对于黄疸、肺炎、过敏性紫癜及肾病综合征等疾病采取中西医结合综合治疗，取得了显著的效果，年收治病人两千余人，全面满足沛县人民就医需求。
儿二科：
沛县中医院儿二科是一个集医、教于一体的中西医结合科室。科室技术力量雄厚，现有医生8人，其中副主任医师1名，返聘专家2名，主治医师2名，住院医师3名；护理人员16人，其中高级护师1人，主管护师7人，护师9人。设有床位79张，年收治三千余人，治愈好转率超95%。能用中西医结合方法对小儿常见病、多发病、疑难杂症、危重症进行有效诊治，对小儿感染性疾病（肺炎、病毒性心肌炎、感染性腹泻）、小儿免疫性疾病（哮喘、过敏性紫癜）、肾病综合征等疾病的治疗取得了明显优于单纯西医治疗的效果，并且总结出了科室独特的临床诊疗经验。全科医护人员刻苦学习专业知识，不断提高专业技能。互敬互爱、团结奋进是科室发展的宗旨，以最好地服务于广大患者为科室的终极目标。
