外科分为外一科和外二科。
外一科：
外一科根据“中西医并重，集中西医之精华，取中西医结合之优势”的办科方针，经不断努力，发展为集临床、教学为一体的徐州市重点专科。有医护人员26人，主任医师2名，副主任医师3人，主治医师2名，硕士研究生1人，床位50张。该科以肿瘤外科、泌尿外科为主，除开展各种急腹症、创伤、外科急危重病等救治外，常规开展泌尿系结石、乳糜尿、泌尿系畸形以及肾、输尿管、膀胱、前列腺、甲状腺、乳腺、食道、肺、胃肠、肝胆、胰腺、脾等脏器肿瘤的根治手术，目前在徐州中心医院帮扶下开展各种腹腔镜手术，尤其开展的经尿道前列腺电切术成为沛县及周边地区的精品领先微创技术。
中医特色优势技术包括：术前及术后使用耳穴压豆、中药穴位贴敷、微波理疗、中药的辩证施治可以有效改善患者术前术后患者疼痛、改善微循环、治疗腹胀、便秘、失眠，可以促进患者术后切口愈合，预防感染等，金黄散外敷治疗乳腺炎、皮肤感染、丹毒、血栓性静脉炎等有特效。运用中医中药治疗肿瘤，减轻了由于放、化疗给患者带来的痛苦，使大量的中晚期肿瘤患者延长了生存期，提高了生活质量。中西医结合治疗前列腺炎、附睾炎、男性性功能障碍、男性不育、精索精囊疾病为特色，配合中药塌渍、中药透入、穴位贴敷治疗前列腺炎性疾病。
外二科：
沛县中医院外二科（普外科）为该院重点专科，现有医护人员二十余名，其中主任医师1名，副主任医师2名，主治医师2名，县拔尖人才1名。开放病床50张，年门诊量约10000人次，年收治病人约2000人，能够熟练地开展肝胆外科、胃肠外科、甲乳外科、胸外科、微创外科等各类大中型手术。在急救创伤外科的急救方面有丰富的临床经验。作为中医院的特色科室，借助于中医中药传统的优势，发挥中医特色，特别在诊治诸如胸、腹部疾病微创治疗粘连性肠梗阻、肿瘤术后的康复治疗、腹部术后促进胃肠功能的恢复等方面有着非常丰富的临床经验。近年来，微创领域内成功开展800余例手术，例如腹腔镜阑尾切除术、腹腔镜胆囊切除术、腹腔镜胆道镜双镜联合胆囊切除+胆总管切开取石术、腹腔镜下小儿疝囊高位结扎术、腹腔镜下疝无张力修补术、腹腔镜下精索静脉曲张高位结扎术、腹腔镜下胃、十二指肠穿孔修补术、腹腔镜下结直肠癌根治术、胸腔镜下肺大泡切除术、胸腔镜下肺癌根治术等，受到上级领导的多次表彰。
