漳州市医院感染科是漳州地区收治各类传染病、肝病的定点医疗机构，是市级结核病、艾滋病唯一指定收治医疗机构；是福建医科大学、厦门医学院传染病学教学基地，福建省住院医师规范化培训基地，福建医科大学孟超肝胆医院（原福州市传染病院）肝病医疗联合体成员单位，福州肺科医院医疗联合体成员单位，漳州市医学会肝病学分会主任委员挂靠单位；是第四批全国人工肝及血液净化技术示范中心，福建省脂肪性肝病规范诊治中心、福建省门静脉高压联盟副理事长成员单位、中联肝健康促进中心“乙肝临床治愈星光计划”2022-2027年度共建分中心医院。目前编制床位80张，科室医务人员40余人，其中高级职称6名、主治医师4名、住院医师7名、副主任护师1名、主管护师3名、护师8名、护士20余名。开设市医院肝病门诊、朝阳分院感染性疾病门诊、结核门诊、龙文分院肝病门诊及朝阳分院感染科病房。长期开展急慢性病毒性肝炎（甲、乙、丙、戊型）、非酒精性脂肪肝、酒精性肝病、药物性肝炎、自身免疫性肝病、遗传代谢性肝病、肝硬化、肝功能衰竭、原发性肝癌、结核病、艾滋病、手足口病、水痘、流行性腮腺炎、流行性感冒、布鲁氏菌病、恙虫病、伤寒、肾综出血热、不明原因发热、不明原因肝功异常，以及登革热、疟疾等输入性传染病的临床诊治工作。
科室拥有高级人工肝血浆置换仪、呼吸机、纤支镜、心电监护仪、全身CT、彩色B超及肝脏组织剪切波弹性成像仪等国内先进设备。目前开展人工肝单纯血浆置换、血浆胆红素吸附、双重血浆分子吸附、半量血浆置换+胆红素吸附、半量血浆置换+双重血浆分子吸附、血液滤过及单纯腹水回输治疗等技术，提高肝衰竭、肝硬化失代偿期顽固性腹水患者治愈率及生活质量。每年开展200～300例彩超引导下肝穿活检术，为慢性乙型病毒性肝炎患者的抗病毒治疗提供有力的病理诊断依据，同时也可为非酒精性脂肪肝、酒精性肝病、药物性肝炎、自身免疫性肝炎、遗传代谢性肝炎及病因不明肝炎等提供病理诊断依据。擅长慢性乙型病毒性肝炎、慢性丙型病毒性肝炎规范化及个体化抗病毒治疗，特殊人群（育龄期妇女、儿童、肿瘤放化疗等）合并慢乙肝的抗病毒治疗；规范结核病诊治，对单耐利福平及耐多药、多耐药、泛耐药肺结核诊断及治疗处于省内先进水平；规范抗艾滋病病毒及相关并发症治疗具有丰富的临床经验及良好的治疗效果。科室重视人才培养，先后派送医护人员到广州、上海、杭州、福州等医院进修学习，不断探索和开展引进新理论、新方法、新技术，不断提高常见传染病的诊治水平及重症传染病的救治水平。近年来不断完善病房的改建，配备多间双人间和普通病房、以及重症需严密隔离的层流病房。病房设有独立卫生间，配备有线电视、空调、呼叫系统、空气消毒机等。
