1972年建科，现有病床71张，医护人员29名，其中主任医师2名，副主任医师4名，主治医师2名，住院医师4名，硕士研究生1名，主管护师5名。年门诊诊疗病人数约5万余人次，年住院病人数达5千人次。医师大多数毕业于福建医科大学，医师多选送至复旦大学附属儿科医院、首都医科大学附属北京儿童医院著名儿童专科医院进修，专业进修新生儿急救、儿童急救、小儿神经、呼吸、肾脏、消化、心血管等专业，并定期选送医护人员到省内外参加短期的业务培训及会议，开展业务，推广新技术。科室拥有现代化医疗设备：美国熊牌（Bear750）呼吸机、瑞士哈美顿（HAmiLTON）呼吸机，德国斯蒂芬（Stephan CPAP）无创呼吸机、美国GE及迈瑞心电监护仪、脉搏氧饱和度测定仪、瑞士美德乐BiliBed蓝光床，经皮测胆红素仪、德国百瑞（PARIjuniorBOY）压缩雾化吸入机、微量血糖测定仪、蓝光箱、蓝灯光、早产儿培养箱、远红外线热辐射抢救台、全套婴儿复苏急救设备、电脑输液泵、微量注射泵等先进设备，确保病人的救治质量。

建科以来，积极开展诊治儿科常见病、多发病、危重症及一些疑难杂症，主要承担小儿内科各系统疾病的诊治和新生儿抢救等工作，引进新技术，开展新疗法，医疗质量和技术水平不断提高，危重病人的抢救成功率逐年提高；精心细致的护理、娴熟的静脉穿刺技术大大减轻了患儿的疼痛。诊疗项目包括：新生儿窒息、新生儿缺氧缺血性脑病、新生儿呼吸窘迫综合症、新生儿吸入性肺炎、新生儿胎粪吸入综合症、新生儿高胆红素血症（黄疸）、低体重及极低体重儿（早产儿）、硬肿症、高危新生儿随访、支气管肺炎、支气管哮喘、慢性咳嗽、小儿腹泻病、各种惊厥、颅内感染（脑炎、脑膜炎）、肾病、癫痫、紫癜等。能开展机械通气、蓝光治疗、静脉留置针、早产儿经外周静脉全胃肠道外营养（TPN）等技术，极低出生体重儿的存活率逐年提升。全县唯一的中英妇幼保健协作项目（新生儿急救中心）于1997年通过专家评估并授牌，危重新生儿的抢救成功率逐年提高；惠安县儿童重症监护室2008年设立于该科，儿科全体医护人员通过儿童救治系统知识及操作技能培训，提高了儿童常见病、多发病防治以及急危重症患儿的识别、转诊和抢救能力，危重症儿童的整体救治能力逐年提高。