内分泌科成立于1990年，是全国建立较早的中医内分泌专科。2004年成为硕士研究生培养学科，2005年评为山西中医院重点学科，2007年被确定为山西省重点中医专科建设科室，2008年成为国家中医药管理局重点专科协作组成员单位，参加糖尿病周围神经病变全国协作工作，为国家药物临床研究机构。 2011年通过省中医药管理局验收，确定为山西省重点中医专科。2012年成为国家中医药管理局“十二五”重点专科建设单位和省中医药重点学科建设科室。

现设有内分泌专科门诊、病房、肌电图室，医护人员29名，其中省优秀专家、硕士生导师2名，主任医师2名，副主任医师1名，主治医师1名，副主任护师1名，主管护师3名，技师1名，床位47张，年门诊量21000余人次。

内分泌科围绕内分泌代谢系统常见病、多发病，突出中医药特色，坚持中西医结合，对糖尿病及其急慢性并发症、代谢综合征、痛风、甲状腺功能亢进与减退症、桥本病、更年期综合征、骨质疏松症等内分泌代谢病形成系列中医、中西医结合疗法。现可进行内分泌疾病系列检查，包括糖耐量、胰岛素、C肽、糖化血红蛋白、胰岛自身抗体、肾系列、神经肌电图及甲状腺系列，性激素系列等项目。已开展中药电脑糖尿病治疗仪、动态血糖监测、胰岛素泵、神经生物电穴位治疗、空气压力波治疗、中药直肠滴入、中药熏蒸、中药足浴等特色治疗。根据多年临床经验，研制了多个制剂品种，如益气化浊胶囊、生津健脾胶囊、三参消渴胶囊、丹芪益肾胶囊、芪葛威灵胶囊、芪菊明目胶囊、九味散结胶囊、消瘿胶囊、芪附温阳胶囊、解郁化痰胶囊等，取得了良好的社会与经济效益。

在科研教学工作中，坚持以临床应用研究为重点，确定优势病种，从中医药治疗糖尿病胰岛素抵抗；中医药防治糖尿病肾病、周围神经病变；理气活血化痰法治疗桥本甲状腺炎；补肾活血中药治疗骨质疏松症等5方面重点展开，进行临床疗效及作用机理研究。协作承担1项国家“十一五”科技支撑计划，承担8项省级科研项目，其中3项获省科技进步奖，1项获新药证书并转让药厂；获国家发明专利1项；参加九项国家新药临床研究，发表学术论文60余篇，专著6部。在研究生培养工作中，已招收10名学生，毕业7名。

在完成医疗科研工作的同时，精神文明建设也常抓不懈，全科医护人员恪守职业道德，开展一切以病人为中心的优质服务，坚持进行患者健康教育，参加人数逾5000人次，荣获国家卫生部、共青团中央授予的全国“青年文明号”光荣称号，山西省直机关劳动竞赛委员会颁发的“五一劳动奖状”，山西省教科文卫体工会授予的山西省教科文卫体系统“文明和谐先锋号”， 山西省卫生厅授予的医德医风建设先进科室等光荣称号。