神经内科组：该院于2005年在内科设立神经科组，病床使用率在90%以上。主要治疗脑梗死、脑出血等脑血管疾病和帕金森病、各型痴呆、及各型头痛、周围神经疾病、脊髓疾病、癫痫、中枢神经感染性疾病等。 至2017年有医护人员24人，其中主任医师1名，副主任医师3名，主治医师3名，住院医师3名，护士12人，其中护师11人。拥有先进、齐全的专科检查设备如多参数监护仪，冰毯、冰帽、16排多功能螺旋CT能开展脑血管病的血管三维成像（ＣＴＡ）检查，多维彩色超声检查仪，经颅多普勒超声检查仪（ＴＣＤ），脑电图机等设备。配合传统医学的针灸、推拿疗法，对神经系统疾病，特别是脑血管疾病的康复治疗取得了显著疗效。 该科采用一级预防和二级预防相结合，显著地减低了脑血管病的发生率；通过经颅多普勒（TCD）检测颅底动脉血流速度，颈动脉彩超测量颈总动脉、颈内动脉血流速度，劲动脉血流，观察动脉粥样硬化的形态特点以及血液流变学、血液抗氧化物含量的测定，可以预测高危人群，早期干预，尽可能防止功能缺损的发生。成功抢救癫痫持续状态，格林巴利综合症合并呼吸肌麻痹，重症肌无力危象等危重病人多例，积累了丰富的临床经验。在治疗脑血管病、癫痫、头痛、头昏、疼痛、麻木、瘫痪、抽搐、语音障碍等方面疗效显著。全科医护人员注重业务学习，先后撰写10多篇学术论文，在国家及省级专业杂志、学术会议上发表。神经内科全体医护人员以优质的服务、优美整洁的环境，精心的治疗、合理的收费为广大患者的康复努力工作。 神经内科常年开设专家门诊和专病门诊，由有丰富临床经验和深受广大患者信任的主任、副主任医师坐诊，并和温州医科大学附属第一院神经内科已开展长期合作，为患者解除病痛。

消化内组：消化科具有病员多、门诊量大、病种多、病情复杂等特点，年门诊量约2万人次，病房年收治病人500多人次。收治各种食管、胃肠及肝胆胰腺疾病患者，在上消化道大出血、急性重症胰腺炎的抢救，消化道息肉内镜下治疗等方面有丰富的经验。 该科内窥镜中心有电子胃镜3台、电子肠镜2台，14C-呼气试验1台，年检查胃镜6000多例，肠镜1500多例。除常规检查外，还可进行无痛胃镜、无痛肠镜检查，内镜下止血、食道狭窄扩张及支架植入、胃肠道息肉摘除、内镜下异物取出术等镜下治疗。

该科现有副主任医师2人、主治医师2人、住院医师2人，在职学习研究生1人，近年共发表省级以上论文30余篇，获乐清市自然科学优秀学术论文奖一等奖2项，二等奖2项、三等奖4项。各级医师学习于温州医学院附属第一医院、温州医学院附属第二医院、上海瑞金医院等名院，使消化科水平再上台阶。该科和温州医学院附属第一医院消化科建立了比较密切的联系，得到他们在技术上的大力支持。