亳州市中医院肛肠科是亳州地区最早的肛肠特色专科，是亳州市中医肛肠重点专科。

经过多年的发展，科室已逐步形成以“微创伤、微疼痛”为特色优势，主要采用结扎、注射、套扎、挂线、直肠环切(pph)等微创无痛疗法，配合中药内服、外敷、外洗、保留灌肠及药膏外用等综合治疗手段，同时结合术后长效无痛技术来治疗各种肛肠疾病。

亳州市中医院肛肠科拥有一支技术精湛、作风严谨的专业肛肠医疗团队。目前科室拥有工作人员17人，包括肛肠临床医师9人（含主任医师1人，主治医师3人，住院医师5人，研究生3人），肛肠护理人员8人，设有专科床位30余张，病房环境干净、整洁、舒适。

科室拥有肛肠治疗仪、已状直肠镜、电子结肠镜、肛门直肠压力测定仪、pph、一次性使用自动痔疮套扎器、肛周熏洗仪、肛周红光照射仪等先进的检查与治疗设备。采用中西医结合全程无痛微创疗法，主治内痔、外痔、环状痔、肛裂、肛瘘、肛窦炎、肛周脓肿、骶尾部脓肿、骶尾部藏毛窦、肛周化脓性汗腺炎、肛乳头瘤、直肠息肉、直肠脱垂、直肠前突、肛门湿疹、肛门瘙痒、肛门尖锐湿疣、肛门狭窄、便秘、腹泻、直肠炎、慢性结肠炎等多种肛门直结肠常见病。

科室应用中医药治疗肛肠病特色突出，通过多年探索，自拟中药复方制剂苦黄洗剂熏浴治疗肛门湿疹、肛门瘙痒、肛窦炎等肛周疾患。自拟中药内服或保留灌肠治疗肛窦炎、直肠炎、便秘、溃疡性结肠炎等肛肠疾病。