药学部为广东省高水平临床重点专科（专科方向：临床药学），是集医疗、教学、科研为一体的大型医技科室,负责全院的药事管理、药学技术服务、药学学科建设发展、药学人才培养等工作。药学部设置药品采购供应与调剂科、制剂科、临床药学科三个亚专科。现有药学技术人员181名，其中高级职称13名，中级职称42名，初级职称124名；其中包括硕导1名，博士研究生3名，硕士29名，本科以上学历占全科人员的80％。
药品采购供应与调剂科设立中、西药库、输液库等库房，中、西门诊药房、住院药房、静脉配置中心等部门。负责全院药品、消毒剂、化学试剂等的采购、保管、发放，以及处方的审核、调配、用药交代、咨询、指导等药学服务。门诊药房于2019年3月全面实现了信息自动化建设，极大程度缩短了取药时间，方便患者。静配中心于2015年10月正式运行，并顺利通过第三方评审验收，目前承接全院的静脉用药的集中配置工作。科学的空间布局、先进的自动化设备、规范的配置流程、专业的药学技术，充分保证了患者静脉用药的调配质量和安全。药品采购供应与调剂科在“以患者为中心”工作理念的指导下，不断提升药学服务质量。
制剂科肩负着医院制剂的研发、申报、配制、治疗药物监测和药物相关基因检测等工作，下设制剂室和药学实验室。秉承我院“传承与创新”精神，使得历经近半个世纪的医院制剂得以延续和发展。目前我院拥有70多个制剂批文，其中26种制剂为我院特有制剂。我院特色制剂以其显著的临床效果、毒副作用小的优势，广负盛名，成为医院的一张极具特色的明信片。同时，在医院的支持下，2000平方制剂转化中心正在筹建，将大大提升我院制剂生产及研究能力。药学实验室，拥有多种先进的检验仪器，具备三大平台功能：制剂质量控制平台、个体化药物治疗检测平台以及科研实验平台。目前开展治疗药物监测项目和药物相关基因检测项目40多项，并于2018年荣获“精准医疗集成应用示范体系建设”示范单位称号。
临床药学科为国家临床药师培训基地，开展了药师查房、个体化用药方案设计、药学会诊、药师门诊、处方点评、药物咨询、药品不良反应上报、循证药学及药物临床研究等工作，积极完成抗菌药物各项监测工作，极大地促进了临床合理用药整体水平的提高。牵头组建“逸仙药学联盟”，与30多家基层医疗机构签约合作，帮扶基层提升药学服务质量，并积极开展线上、线下相结合的全覆盖药学服务模式为患者提供药学咨询服务。大力开展药学科普工作，开展药学志愿者活动，宣传合理用药知识；创建了包括今日头条号“逸仙药师”在内的多个药学互联网传播新媒体平台，发表多篇药学原创科普，充分发挥了临床药师的职业价值和社会价值。
“安全合理用药，药师与您同行！”中山大学孙逸仙纪念医院药学部将不断提升药学专业技术水平，优化工作思路，积极拓展药学服务范围，以严谨、踏实、热情的工作态度为广大患者朋友及医护人员提供优质的药学服务。
