广州医学院第二附属医院麻醉科正式成立于1989年3月，成立初期主要工作任务是临床麻醉。麻醉科经过20余年的发展，现已成为集医疗、教学、科研于一体的临床二级学科。近几年来，麻醉科坚持“临床为本，教研强科”的学科发展思路，不断积累，学科建设步入较快发展时期。1989年开始开展手术后连续硬膜外镇痛（PCEA），1991年开展静脉自控镇痛（PCIA），1997年开展皮下自控镇痛（PCSA）。1993年建立麻醉后监护室（PACU），设监护床两张，1999年新手术室建成后，PACU扩大到监护床5张，拥有多功能监测仪、呼吸机、床旁血气分析仪、微量血糖仪、微量输注泵、保温装置、加压输液等设备，并配有一名专职医师，六名专职护士。1989年开始开展分娩镇痛，2001年开展门诊无痛麻醉，包括无痛人工流产、无痛胃肠镜麻醉，2004年开展无痛宫腔镜麻醉。随着医学的发展与科学技术的进步 麻醉科工作范围不断扩大，业务覆盖全院所有手术科室的临床麻醉、手术病人麻醉后监护、手术后镇痛，门诊麻醉、以及危重症处理。
1989年开设疼痛门诊，1997年3月开设疼痛病房，设病床10张，1999年3月经省卫生厅批准成立中华疼痛学会第一临床中心。2008年6月正式设置麻醉科的三级分科-疼痛科。
1999年6月正式成立麻醉学教研室，并被批准为麻醉学硕士学位授予点，开始麻醉学硕士研究生教育。2004年9月广州医学院麻醉学系成立，由第二临床学院管理，专业负责人由麻醉科主任兼任，开始了麻醉学专业本科（五年制）教育。
麻醉科技术力量较强，现有麻醉医师30名（不含疼痛科），麻醉护士10名，体外循环灌注师1名，灌注护士1名。医生队伍中有教授/主任医师3名，副教授/副主任医师12名,讲师/主治医师8名；其中博士4名，硕士12名，在读博士1名，在读硕士3人；有硕士研究生导师2人。人员梯队的年龄、职称、学历结构合理，高级职称人员均形成了自己具有特长的专业发展方向。麻醉护士本科学历3人，大专8人；主管护师7人。
广州医学院第二附属医院建有手术室21间。麻醉科设备配套齐全，每间手术室均配有先进麻醉机1台、多功能监护仪1台、微量注射泵2台、多功能麻醉车1台，以及备有常用麻醉药品、急救药物及基本麻醉与应急用品。每层手术室配有除颤器、血气分析仪、快速输血系统、输液/血加温器、血糖仪、肌松监测仪、神经刺激器、血液回收机、凝血功能监测仪、纤维支气管镜、可视喉镜等设备。麻醉复苏室（PACU）拥有多功能监测仪、呼吸机、床旁血气分析仪、微量血糖仪、微量输注泵、保温装置、加压输液、转运呼吸机和转运监护仪等设备一批。
麻醉学实验室于2007年初步建成投入使用，面积约160 m2，是教学科研一体的综合实验室。能满足本科生基础课程与临床课程的实验课和模拟训练课，以及本科生课外科技活动、研究生和教师开展基础研究。其中分子生物学实验室配备了低温冰箱、二氧化碳培养箱、荧光倒置显微镜、生物显微镜及图象分析系统、冰冻切片机、组织切片机、低温离心机、小动物麻醉机、蛋白电泳仪等实验仪器。至此，实验室逐步建立了比较规范的管理制度。
