全科医学科的前身为综合病区，组建于2008年，为番禺区亚运会指定收治病房，发展至今已有15年历史，随着学科的发展需要2022年2月更名为全科医学科。2014年开始成为全科医学科住院医师规范化培训协同基地，全科规培学员25人。目前是中山大学第一附属医院住院医师规范化培训协同基地，现有在培学员4人。
番禺区中心医院全科医学科是唯一指定番禺区全科医生转岗培训单位，同时也是广州市医师协会肠内外营养分会副主任委员单位，番禺区医学会老年病分会主任委员单位。
科室设有全科医学科医学病房、全科医学科门诊，全科医学科教学门诊。病房设置床位33张，临床医生9人，包括主任医师2人，主治医师4人，住院医师3人，其中硕士学位4人。护士13人，其中主管护师5人，是一支结构合理，具有较强临床、教学与科研能力的人才队伍。
全科医学科是一个朝气蓬勃、焕发生机的年轻的学科。科室主持省、市、区级科研项目5项，发表SCI论文3篇，核心、国家及省级期刊20余篇，主编《老年病的诊疗》1部，参编《全科医学科》1部。
