内分泌科正式建制成科于1987年2月，其前身为神经内科内分泌组。博士1人，硕士5人。主任邓爱民，副主任金文胜。主要收治甲状腺疾病、糖尿病，以及下丘脑、垂体、肾上腺、性腺、痛风等内分泌代谢疾病。

1978年，该科在广东地区率先开展了放射免疫法测定血清T3、T4,血凝法检测血清甲状腺自身抗（TGA、TMA）。1985年在广东地区率先开展甲状腺细针吸取细胞学检查（FNAB）及甲状腺囊肿的抽液注药治疗。近14年已开展FNAB检查甲状腺病患者5000例，发表系列研究论文多篇及获多项奖项，是国内开展FNAB技术最早及研究病例最多的单位之一。1986年以来，先后开展了甲状腺病肌电图和超微结构观察、甲状腺局部注射小剂量地塞米松治疗自身甲状腺病、他巴唑小剂量顿服法治疗甲亢及甲亢性心脏病的临床研究。1994年开展了TSH受体抗体测定及无水乙醇局部治疗甲状腺良性结节。1997年，开展了糖皮质激素及中药免疫抑制剂治疗重症甲亢及131I治疗甲亢后的严重反应研究并发表论文，1998年以来开散发型无痛甲状腺炎（SPT）的临床研究并首次在国内报告。2004年，开展多点皮下注射长效糖皮质激素治疗胫前粘液性水肿，治愈患者10余名，发表系列研究论文多篇，并多次在国内会议上交流。2005年以来，科室对专科疾病的诊治开始向多元化发展，加大对内分泌系统罕见、疑难病的诊治力度，先后收治垂体柄离断综合征、垂体柄朗罕氏细胞增生、假两性畸形、皮肤骨膜肥厚症等罕见病例，发表个案报导及论著数篇，并在华南地区形成良好的声誉，许多外地患者慕名而至。2007年，购进糖尿病足检查仪器，开展外周神经病变及血管病变筛查400余例，并开展了动态血糖监测，提高了科室的诊治水平和经济效益。同年借独立成科的契机，建立了内分泌科监护病房，引进多功能监护仪，提高了重危患者的监护和抢救水平。2009年和相关科室合作引入最新一代骨密度仪，使该科在骨质疏松诊治方面跨入国内领先行列。内分泌科开设普通门诊2个，专家门诊1个，并由专人固定时间开设骨质疏松、糖尿病、甲亢专病门诊，本着心全意为人民服务的优良传统，坚持每月进行糖尿病义诊1次，为市民提供免费测血糖服务。