神经外科成立于2013年。设床位39张，是医院重点学科，现有医师6人，副主任医师1人，主治医师3人，医师2人。神经外科（外三科）拥有：颅内后检监仪1台、心电监护仪多台、微量输液泵2台等设备。是目前我市规模和实力雄厚的神经外科专业科室。神经外科熟练开展了脑膜瘤及神经脑质瘤等肿瘤的摘除术，脑积水分流术、颅骨缺损数字成型钛网修补术、颅内血肿微创引流术，各种颅脑损伤及脑出血开颅手术等。

余干县人民医院于上世纪80年代后逐渐开展了大量脑外科工作，除了常见脑外伤的救治，还开展了脑肿瘤、脑出血等手术。90年代后引进了余干县第一台CT，脑外科各种疾病的诊断和治疗水平有了质的飞跃，手术成功率也有了很大提高。2013年正式成立脑外科病区（外三科），现我院脑外科有核定病床50张，并拥有呼吸机一台、颅内压检测仪、心电监护仪多台，病房条件优越。有专业脑外科医师出有名名，并有14名专业的护理队伍，医护技术力量雄厚。有多名医师先后在北京、上海、广州、南昌等大型医院进修学习脑外专科，可同时开展三台脑外科手术。目前脑外科以颅脑创伤及高血压脑出血为基础，承担着余干县全部脑外伤及脑出血等脑外科疾病抢求、治疗。我科熟练开展了脑膜瘤及神经胶质瘤等肿瘤的摘除术、脑积水分流术、颅骨缺损数字成型钛网修补术、颅内血肿微创引流术、各种颅脑外伤及自发性脑出血开颅手术等。依托医院新购置的16排螺旋CT及CTA、核磁共振等大型设备。极大的提高了颅脑各种疾病的诊疗水平、使脑外科在脑外伤及脑出血等疾病的救治成功率有了很大的提高。

脑外科与南昌大学一附院、二附院等有良好的合作关系，可随时联系以上医院专家会诊、手术。