感染内科是2008年组建的临床科室。是冕宁县境内唯一具有感染病隔离功能的病区。病区设备设施齐全，常年收治肺结核、病毒性肝炎、手足口病、急性细菌性痢疾、水痘、麻疹、腮腺炎等传染性疾病，收治伤寒、沙门氏菌、蛔虫症等发热性病。感染内科根据《中华人民共和国传染病防治法》相关规定及各种传染病的传染性、传播途径等特性分别进行严格的消毒隔离。自建科以来无一例交叉感染发生，为病员提供安全、高效、优质的服务。

感染内科目前共有医务人员9名。副主任医师1名，资深医师2名，经验丰富的住院医师2名，主管护师1名，经验丰富的护师3名。全科医护人员都经过严格培训或到多次参加省级、州级的进修或短期学习，对传染科、儿科、内科疾病的诊断、治疗有丰富的临床经验。

感染内科常年开设发热门诊、腹泻门诊以诊治发热、腹泻病人和慢性乙肝的抗病毒治疗等。设有住院部二层楼。开设消化道隔离、呼吸道隔离、血液-体液隔离、接触隔离病房，每间病房2张床，共20张床位。另外冕宁县的艾滋病抗病毒治疗中心、肺结核的诊断治疗中心也设在感染内科。感染内科实行24小时值班。本着全心全意为人民服务的宗旨，最大限度遏制冕宁县传染病的发生。