神经内科分为一病区和二病区。
一病区：
神经内科是医院治疗脑血管疾病的专业科室，主治脑梗塞、脑出血、一过性脑缺血发作及各类头痛头晕。已成熟开展缺血性脑梗塞的静脉溶栓治疗，以及缺血性脑血管病的二级预防，极大降低了该市脑血管病的发病率及致残率。科室现有床位71张，其中监护病床6张，用于24小时时时监测危重症患者的生命体征。共有医护人员24人，其中高级职称1人，中级职称5人，专科护士2人，初级职称16人。 科室系阜阳市重点特色专科，已积极与蚌埠医学院神经内科形成学科共建单位，力将上级医院的医疗技术和管理经验输血到体，造血到髓。蚌医专家于每周五、周六来科坐诊、查房、参与疑难病例讨论，进一步提高了科室的诊治疑难病例水平。
二病区：
界首市人民医院神经内科二病区系全科首批卒中单元创建科室、全国脑卒中筛查与预防控制中心、阜阳市重点专科。由科主任刘勇带领一批具有丰富临床经验的医务人员组成。在宋锡峰院长的指导下，该科已具一定规模和专科医疗特色。 该科拥有住院病床62张，医护人员23人。其中医师7人，（副主任医师2人 、主治医师3人、住院医师2人），护士16人（主管护师4人、护师5人、护士7人）。门诊部及住院部配置齐全，设备精良、技术全面、人员素质极佳，多名医务人员先后获得院先进个人、十佳医师、界首市卫生先进个人等荣誉称号。 目前科室主要运用头颈部MR、CT、CTA、脑电图等检查手段，诊治脑梗塞、脑出血、头晕头痛、脊髓炎、癫痫、痴呆、神经系统变性病、周围神经病（四肢麻木、无力）及重症肌无力等疾病。同时在脑卒中一、二级预防治疗方面经验丰富。曾在全市范围内开展颅内血肿微创清除减压术，以治疗高血压脑出血；硬膜下血肿、脑梗死早期溶栓及卒中单元病房治疗，改善了脑血管病人的预后，提高了病人的生活质量。科内设有监护病房，心电监护仪、注射泵配备充足，以便时时监测危重症患者的生命体征。而远程床旁心电图机的运用，极大提高危重症病人的抢救成功率。 长期以来，该科按照既定人才培养计划，先后委派多名骨干人员进修学习，构建合理的人才梯队。加之近期正式与蚌埠医学院第一附属医院神经内科联合共建科室，促使该科神经系统的疑难病例诊治技术突飞猛进。
