针灸推拿科（针灸科）是国家中医药管理局重点专科、广东省高水平临床重点专科、广东省中医重点专科、深圳市医学重点学科、深圳市中医临床重点专科，是国家中医技术协作组成员单位，中医临床科研一体化院士工作站、深圳市三名工程——中国中医科学院刘保延首席研究员团队、深圳市针灸医疗质量控制中心、深圳市中医临床研究方法培训基地的依托科室。

针灸推拿科创立于1975年，设有2个门诊、2个病区、康复中心、肌电图室、针灸现代应用研究重点实验室。专科首创“调任通督针法”，用于中风、失眠、抑郁障碍、不孕症等疾病的治疗。

开展中医特色疗法20余项，包括靳三针、火针、浮针、蝶腭神经节针法、艾灸、督脉灸、穴位贴敷、穴位埋线、放血等，用于治疗包括中风、面瘫、三叉神经痛、偏头痛、失眠、抑郁等神经精神类疾病，颈肩腰腿疼、膝骨关节炎等痛证；不孕、痛经、盆腔炎等妇科疾病，小儿脑瘫、自闭症等儿童发育疾病，带状疱疹、慢性荨麻疹、痤疮等皮肤病，及便秘、压力性尿失禁、过敏性鼻炎、耳鸣耳聋、肥胖、疲劳综合征等病，具有满意的疗效。

针灸推拿科技术力量雄厚，人才梯队结构合理。学科带头人杨卓欣教授及学术带头人于海波教授共同带领专科发展。专科现有省名中医1名，市名优中医4名，博士生导师4名，硕士生导师8名，高级职称医师21名，博士11名，硕士31名。专科承担包括国家重点研发计划、国家自然科学基金等各级课题80余项，发表论文300余篇，SCI10余篇，申请专利19项，获得各级科技奖励近20项，出版专著10余部。