耳鼻喉科于2012年3月由原五官科分离出，成为一个集耳、鼻、咽喉、头颈外科于一体的专业科室，开放病床45张，还设有专科门诊、变态反应室、睡眠呼吸监测室等。拥有医护人员23名，其中副主任医师2名，主治医师2名，住院医师5名，主管护师3名，护师10名，护士1名。大部分医护人员曾先后多次到上海、昆明等各大医院进修学习，并引进多项先进的医疗护理技术。2011年被医院列为优质护理示范病房之一。
科室配有进口及其它著名品牌鼻内镜手术系统3套，日本进口纤维鼻咽喉镜3套，丹麦国际听力纯音测听仪电测听、声阻抗、耳声发射、脑干诱发电位，耳内镜，支撑喉镜，食管镜、气管镜、睡眠呼吸检测仪、耳鼻咽喉微波治疗仪、耳鸣治疗仪、手术显微镜等一系列国内外先进的专科检查和治疗设备。
专科门诊由经验丰富的专科医师及专家坐诊，开展上颌窦穿刺冲洗、鼻负压置换治疗、鼻甲及咽喉部的微波治疗、慢性鼻炎激光治疗、鼻纤维咽喉镜检查、耳内镜检查、听力学检查、助听器验配、耳聋耳鸣治疗。变态反应室对过敏性鼻炎、支气管哮喘、皮肤过敏、春季卡他性结膜炎等过敏性疾病查找过敏原，并进行脱敏治疗。
科室开展各种功能性鼻内镜鼻腔鼻窦手术，该手术为当今治疗鼻窦炎的主流，具有视野清，创伤小，颜面部不留疤痕，术后恢复快等特点。开展耳显微外科手术，行乳突根治，鼓膜修补，鼓膜置管术。还开展鼻侧切开术、喉裂开术、食管气管异物取出术、声带肿物摘除术、扁桃体摘除术、腺样体刮出术、鼾症监测及治疗、头面部骨折整形复位内固定术，参与微笑列车行动，为唇裂患儿免费手术。
科室于2014年12月25日被中共云南省委组织部，云南省人力资源和社会保障厅批准在腾冲市人民医院设立首批专家基层工作站，并邀请昆明医科大学第一附属医院耳鼻咽喉头颈外科主任，一级主任医师（二级教授），法国波尔多第二大学医学博士，博士研究生导师何晓光教授为专家工作站负责人，主要帮助科室开展阻塞性睡眠呼吸暂停综合征（OSHS）的临床诊疗及科研，同时指导科室喉癌、咽喉颈部良、恶性肿瘤手术及嗓音学诊治，并取得良好的社会效益。
