新疆自治区人民医院小儿外科自1995年以来正式开展小儿及新生儿外科工作。2004年7月正式挂牌成立小儿外科。

现科室有固定开放床位80张，目前有医生19名，其中主任医师1名、副主任医师6名、主治医师6名、住院医师6名。小儿外科目前设有新生儿外，小儿普外，小儿泌尿外科，小儿胸外科、小儿肿瘤等专业。小儿外科不断吸取国内外先进经验，积极开展新技术，以精湛的技术、优质的服务、良好的医风为广大患者服务。

小儿外科目前成为新疆医学会普外学会小儿外科学组组长单位，成立以来开展了大量的新技术，新业务，尤其是新生儿外科、小儿普外科、小儿微创手术以及泌尿系结石内窥镜的领域填补了疆内多项空白，达到国内发达地区先进水平，小儿外科在现有基础上不断推陈出新，学术研究和交流方面与北京，上海等地专家密切合作，采用请内地专家来院指导交流，派人员去内地进修学习相结合的方法，不断提升我院的专业技术水平，自2009年以来，积极开展小儿腔镜微创手术，目前微创治疗腔内疾病达90％以上，使原有的开放手术模式逐渐向腔镜微创手术模式过度，使广大患儿受益。

小儿外科在不断茁壮成长的过程中，坚守科研、教学、医疗为一体的发展思路。教学方面，小儿外科为18个国家级专科医师培训基地之一（小儿外科培训基地组长单位）。目前承担了新疆医科大学，石河子大学医学院本科班教学任务，疆内各地州小儿外科专业进修人员，规范化培训医师，实习医师的培训及带教任务，临床护士的进修及实习带教任务。科研方面，承担并完成了国家卫生部科技计划项目1项，国家卫计委行业专项课题1项，目前承担自治区卫健委适宜技术推广项目2项，自治区自然科学基金项目3项，自治区青年自然科学基金项目1项，自治区卫健委青年科技项目1项。先后在核心及省级医学刊物上发表论文及论著40余篇，其中SCI 1篇，中华系列杂志17篇；获得院级科技成果奖及新技术奖30余项。