耳鼻咽喉中心作为耳鼻咽喉科研究所福建基地，汇集着中国耳鼻喉医学领域的医学泰斗杨伟炎、中科院院士曾毅等知名专家，是为适应新时期发展战略而组建的、省内领先的耳鼻咽喉中心，也是福建地区三甲医疗机构中首家耳鼻咽喉中心。

中心开设了耳科、鼻科、咽喉科、头颈外科、颌面整形外科、睡眠呼吸检测中心、鼾症治疗中心、鼻咽癌防治中心等科室，能完成耳鼻鼾症治疗中心、鼻咽癌防治中心等科室，能完成耳鼻、头颈外科领域的各类疾病的诊断及治疗，并可开展包括喉癌根治及发音重建术、各种头颈部肿瘤切除术及手术后缺损的转移性皮瓣修复术、先天性外耳、中耳畸形整形手术、面瘫的面神经减压及移植手术等在内的各种高难度、高风险手术。作为中华慈善总会“微笑列 车”定点单位，已免费为数百名福建、江西、西藏等地唇腭裂患者进行了矫治。

中心引进CORE综合动力系统(德国Stryker)、鼻窦内窥镜及图象处理系统（德国Storz）、纤维鼻咽喉镜工作站（日本Pentax）、低温等离子手术系统（德国Sutter）、目前世界最先进的PTT（脉博传导时间）睡眠呼吸检测系统、鼻咽癌检测等一大批专业诊疗设备，保证了耳鼻喉疾病诊断的准确性和治疗的成功率，使中心在全省同行业中保持领先优势。