中医科是国家中西医协同“旗舰”医院建设试点项目。现拥有主任医师3名（其中福建省名中医1名，上海专家1名），副主任医师1名，住院医师2名。
我科遵循祖国传统医学理论，以小儿的生长发育、生理病理特点为基础，通过辨证论治，采用中药内服、针灸、推拿、贴敷、熏洗等中医特色疗法，凭借“简、便、验、廉”等特点，针对儿童不同体质，不同生长周期，不同好发疾病采取个性化的诊疗手段，达到“未病先防，既病防变，愈后防复”的效果。
主要治疗小儿过敏性鼻炎、慢性咳嗽、哮喘、反复呼吸道感染、厌食、积滞、便秘、慢性腹泻、腹痛、抽动症、肥胖、性早熟等儿科相关疾病，为患儿提供“全生命周期化管理”的中医综合诊疗。
中医科开展如下特色专病门诊：
儿童体质调理门诊：
针对易感、瘦小、厌食、夜醒、多汗、便秘、腹泻等问题。
2.中医儿童鼻：
腺样体肥大门诊。
针对鼻塞、鼻痒、流涕、打喷嚏、张口呼吸等问题。
3.中医儿童肾脏病门诊：
针对血尿、蛋白尿、过敏性紫癜、肾病综合征等。
4.中医儿童抽动、多动症门诊：针对注意力不集中、多动、不自主抽动等问题。
5.中医儿童性早熟门诊：
针对乳房早发育、阴毛早现、身材矮小等问题。
6.青春期妇科门诊：
针对青春期儿童痛经、月经不调、经期前后综合征等问题。
中医科开展如下特色外治：
1、穴位敷贴：
（1）生长贴：具有补先天、调脾胃，助睡眠从而助生长的功效。
（2）厌食贴：具有调理脾胃、促进食欲、提高抗病能力的功效。
（3）腹痛贴：具有缓急止痛，调理脾胃的功效。
（4）便秘贴：具有软坚散结，益气通便的功效。
（5）化痰贴：具有化痰止咳的功效。
（6）三伏贴、三九贴：具有宣通鼻窍，扶正祛邪的功效。
（7）退热贴：具有退热、清湿热的功效。
2、无痛针灸治疗：
适合鼻炎、腺样体肥大、性早熟、抽动症、注意力不集中、多动等疾患。
（1）揿针：属于微型针灸针，尤其适合畏针、怕针的患儿，具有安全、方便、无痛、无副作用，疗效稳定持久的特点。
（2）普通针刺：采用飞针手法快速进针，针对不同疾病、体质辨证取穴，达到疏通经络、条畅气血，扶正祛邪的功效。
3、小儿推拿：
通过推拿按摩提高小儿机体机能，强身防病，缓解病痛。
适合：有鼻炎、咳嗽、便秘、厌食、腹痛、腹泻、抽动、多动、注意力不集中等疾病及需要体质调理的小朋友。
4、中药熏洗：
利用中药煎汤外洗，使药物有效成分通过皮肤渗透吸收，具有发汗祛风、解表清热、透疹解毒、祛风止痒的功效。
适合：用于有湿疹，发热的小朋友。
