商丘市中医院针灸推拿科由针灸科和推拿科组成。科室经过近几年跨越式发展，现已成为“商丘市重点特色专科”、“全国针灸临床研究中心商丘分中心”、“河南邵氏针灸流派二级工作站”、“商丘市针灸推拿诊疗中心”“中国民族医药学会疼痛分会-内热针临床基地”“河南中医药大学第三附属医院针灸推拿专业专科联盟单位”“商丘市名科”，2009年针灸推拿科被市总工会授予“工人先锋号”光荣称号。科室人才济济，拥有针灸医师与推拿医师多名业务骨干，每年定期派人研修深造，开展学术交流，形成了良好的技术团队与人才梯队。科室现有治疗床位50多张、配有大型全自动四维多功能牵引床、氦氖激光治疗机、HYZⅡ大型中药熏蒸雾化治疗床、超短波治疗仪、高档中低频电脑辩证治疗机、九段位手法整脊治疗床、智能通络治疗机、内热式针灸治疗仪等先进理疗设备。

科室以“传承经典薪火，汇集全国特色，优化创新，防治并重”为指导原则，海纳百川，中西合璧，集传统医学与现代医学为一体，突出针灸推拿中医特色，临床诊治的疾病涵盖内、外、妇、儿、骨科、急症、五官、皮肤各科多达100余种。尤其以针灸推拿为主治疗颈椎病、腰椎间盘突出症、中风病、抑郁症、焦虑症、痛风性关节炎、软组织损伤、骨性关节炎、肥胖、血管性头疼、脑脊髓炎外伤所导致的偏瘫、帕金森氏综合症、慢性疲劳综合症、脑供血不足引起的眩晕、面瘫、慢性结肠炎、哮喘、过敏性鼻炎、湿疹、荨麻疹、月经病等疾病疗效显著。目前开设有瘫症（偏瘫、脑瘫、面瘫）、疼痛，颈肩腰腿痛，过敏性疾病、不育症、减肥、风湿病、失眠、亚健康症状调理9个专病专科。

科室精研针灸整体调节优势，精选有效穴位，充分运用疏肝调神大法，治疗现代社会多发的抑郁症、焦虑症、制定了有效的以“人中，内关,神门为主穴的多型临床路经图，临床疗效确切。吸引大批患者前来就诊。