蒙医肝胆脾胃病科始建于1980年，国家中医药管理局“十二五”中医药重点学科建设单位。科室开放床位40张，现有医护人员26人，其中主任医师2人，副主任医师1人，主治医师5人，住院医师2名，研究生5人，护士16人。科内多人先后在中国人民解放军总医院301医院、北京海军总院消化内科、北京友谊医院肝病科、北京解放军总医院第一附属医院神经内科进修学习。

科室以蒙医辩证施治为主导理论，蒙西医结合治疗急慢性病毒性肝炎、脂肪性肝病、酒精性肝病、重型肝炎（肝衰竭）、各型肝硬化腹水，消化道出血、急慢性胆囊炎、胃溃疡、结肠溃疡、急慢性胰腺炎等消化系统疾病，蒙药结合放血疗法、推拿、针刺、蒙古灸、震脑术等十多种手法治疗脑梗死、脑供血不足等脑血管及神经系统疾病。拥有特色院内制剂，其中古日古木-13、嘎日西、泵嘎日-17、珍宝丸、扎冲十三味丸等自制蒙药提高了治疗效果，患者给出了满意的评价。科室护理团队开展优质护理以来突出蒙医护理特色，重视健康教育，被评为全国中医院“优质护理先进病房”。