泌尿外科，现有固定床位21张，现有医师7名，其中主任医师3名，副主任医师2名，主治医师1名，住院医师1名。拥有较强的专业技术能力和科研教学能力。
科室仪器设备先进：现有德国进口wolf膀胱镜、输尿管硬镜、输尿管软镜、等离子电切镜、精囊镜；美国科医人钬激光；单导管超声碎石系统；加拿大莱博瑞尿流动力学分析仪；天津蓝莫德结石分析仪；深圳海德体外冲击波碎石机；另外还有德国storz腹腔镜。目前输尿管软镜、精囊镜、结石分析仪，是菏泽首家拥有者。
wolf输尿管硬镜、输尿管软镜；美国科医人钬激光；单导管超声碎石系统；天津蓝莫德结石分析仪；深圳海德体外冲击波碎石机；多种设备结合，使我们从泌尿系结石的诊治到结石成分分析乃至给患者提出合理化预防结石建议，提供了泌尿系结石全程管理的强有力保障。
针对肾结石、输尿管结石、膀胱结石、尿道结石等我们可以采取多种手段进行治疗，满足不同患者的不同预期，也使我们结石治疗成功率得到大力提升。
德国wolf等离子电切镜、加拿大莱博瑞尿流动力学分析仪，两者配合，有效解决前列腺增生症病人的痛苦，使治疗方案更合理，治疗效果更确切。
泌尿外科可治疗肾上腺肿瘤、泌尿生殖系先天畸形、泌尿生殖系感染与结核、泌尿系男生殖系肿瘤、尿石症、前列腺疾病、泌尿系创伤、尿失禁、尿道疾病、男性生殖系统疾病等疾病。
主要开展手术包括各种肾脏手术、肾上腺手术、输尿管手术、膀胱手术、前列腺手术、尿道手术以及睾丸附睾手术。开展的微创手术有经尿道前列腺等离子电切术、经尿道膀胱肿瘤电切术、输尿管（软、硬）镜碎石取石术、腹腔镜下肾囊肿去顶术、腹腔镜下精索静脉高位结扎术、腹腔镜下输尿管结石切开取石术等。这些微创手术在菏泽市医院中处于先进水平。
