药学部是集药学服务、科研、教学等为一体的重要医技科室，是药事管理与药物治疗学委员会的常设办事机构。现任药学部主任是钟小斌主任药师。
药学部下设有门诊药房（包括急诊药房、儿科药房、干保药房、传染药房）、住院部药房、西院药房、药库、临床药学、制剂室6个部门。医院开放床位总数达2500张，门诊日处方量达6000余张。所有药房均施行信息化管理模式，及时、快捷、优质地为患者提供服务。
临床药学经过十几年的探索和努力，开展了临床药师药学服务、药品不良反应监测、血药浓度监测、合理用药研究与咨询、全静脉营养支持等方面工作，均取得了显著的成绩，为广西培养了大量从事合理用药工作的药学人才。临床药师队伍已经成为医院临床合理用药中不可缺少的技术组成部分。2006年12月批准为卫生部临床药师培训试点基地，成为广西培养临床药师人才的摇篮。制剂室负责配制医院制剂，医院获批准文号的制剂有109个，年配制量（按零售价计）约300万元，能较好地满足临床需要。
药学部在科研方面，以临床合理用药的研究、药物不良反应的防治与控制、医院制剂的开发与研究为主要研究内容，近两年来获得1项国家自然科学基金项目、广西自然科学基金1项、广西中医药管理局科研项目3项，完成课题3项，获得广西科学技术进步奖二等奖1项，广西医药卫生适宜技术推广奖二等奖1项，发表论文100余篇。药学部一直承担广西医科大学药学本科部份课程的教学及硕士研究生、实习生、进修生的带教。负责编辑《医院药学》，为临床医护人员提供药学情报信息。
药学部全体员工树立“以病人为中心”的服务理念，坚持以合理用药为核心，为患者提供安全、有效、经济的用药服务。
布谷医生
