孙逸仙纪念医院普通外科是国家临床重点专科，是华南地区规模最大和整体实力最强的同类专科之一，在2018年度华南医院最佳专科排行榜（复旦版）位列第二。深汕医院普通外科医疗团队技术骨干人员均来自孙逸仙纪念医院本部，现科室分为肝胆胰外科、胃肠疝外科、乳腺小儿外科三个亚专科，集医疗、科研和教学为一体，是目前汕尾地区治疗普通外科疾病综合诊治实力最强的科室，承担区域高发肿瘤、疑难危重症、重大突发公共卫生事件相关医疗救治，以及普通外科高层次专业技术人员培养与医疗技术应用推广等任务。学科整体实力雄厚、专业技术水平突出，科室现有正高职称2名，副高职称1名，中级职称2名，其中博士生导师2名。

肝胆胰外科拥有3D腹腔镜、荧光腹腔镜、内镜超声等先进设备，整体水平达到省内先进水平，具备对肝胆胰疑难疾病的规范诊疗能力胃肠疝小儿外科主攻胃癌、结直肠癌、腹外疝的微创治疗，并致力于小儿外科及肛肠疾病的规范治疗。对于恶性肿瘤患者的新辅助治疗和术后胃肠功能康复有丰富的临床治疗经验。乳腺外科是国内最早开展乳腺癌保乳和腋窝前哨淋巴结活检的乳腺专科之一，居全国领先水平。专科特色有乳腺良性肿瘤的微创手术治疗、乳腺癌保乳手术，并常规开展前哨淋巴结活检术，提高了保腋窝率，减少了患肢淋巴水肿发生率，改善患者的生活治疗。